Táto práca má za cieľ pomôcť pri klasifikácii krížencov smútočných vŕb, prispieť k objasneniu taxonomických vzťahov medzi vŕbou babylonskou (Salix babylonica), vŕbou bielou (Salix alba) a vŕbou krehkou (Salix fragilis) a ich krížencami. Pri objasnení týchto vzťahov bola použitá metóda DArTseq genotypovania a štatistické analýzy (skórovanie alel, PCoA, Neighbor-joining). Získané výsledky môžu slúžiť ako podklad pre novú nomenklatúru.
Anotace v angličtině
The aim of this work is to help with the classification of hybrids of weeping willows, to help clarify taxonomic relationships between Salix babylonica, Salix alba, Salix fragilis and their hybrids. The DArTseq genotyping method and statistical analyses (allele scoring, PCoA, Neighbor-joining) were used to elucidate these relationships.The results obtained may serve as the basis for the new nomenclature.
Táto práca má za cieľ pomôcť pri klasifikácii krížencov smútočných vŕb, prispieť k objasneniu taxonomických vzťahov medzi vŕbou babylonskou (Salix babylonica), vŕbou bielou (Salix alba) a vŕbou krehkou (Salix fragilis) a ich krížencami. Pri objasnení týchto vzťahov bola použitá metóda DArTseq genotypovania a štatistické analýzy (skórovanie alel, PCoA, Neighbor-joining). Získané výsledky môžu slúžiť ako podklad pre novú nomenklatúru.
Anotace v angličtině
The aim of this work is to help with the classification of hybrids of weeping willows, to help clarify taxonomic relationships between Salix babylonica, Salix alba, Salix fragilis and their hybrids. The DArTseq genotyping method and statistical analyses (allele scoring, PCoA, Neighbor-joining) were used to elucidate these relationships.The results obtained may serve as the basis for the new nomenclature.
1. Literární rešerše ke studované problematice (problematika smutečních vrb, Salix babylonica agg.)
2. Laboratorní výzkum: extrakce DNA a její příprava pro DArTseq genotypování (alespoň 50 vzorků Salix babylonica agg. a potenciálních rodičovských druhů kříženců).
3. Vyhodnocení výsledků a jejich shrnutí a interpretace.
Zásady pro vypracování
1. Literární rešerše ke studované problematice (problematika smutečních vrb, Salix babylonica agg.)
2. Laboratorní výzkum: extrakce DNA a její příprava pro DArTseq genotypování (alespoň 50 vzorků Salix babylonica agg. a potenciálních rodičovských druhů kříženců).
3. Vyhodnocení výsledků a jejich shrnutí a interpretace.
Seznam doporučené literatury
Vašut R. J., Sochor M., Hroneš M., Brandová B., Klečková L., Nývltová V. & Ševčík J. (2013): Vrby české republiky. – Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc. ISBN 978-80-244-4121-4.
Santamour F. S. & McArdle A. J. (1988): Cultivars of Salix babylonica and other Weeping Willows. – Journal of Arboriculture 14: 180-184.
Jaccoud D, Peng KM, Feinstein D, Kilian A (2001): Diversity Arrays: a solid state technology for sequence information independent genotyping. – Nucleic Acid Research 29: e25 (DOI: 10.1093/nar/29.4.e25).
Przyborowski, J.A.; Sulima, P.; Kuszewska, A.; Załuski, D.; Kilian, A. (2013): Phylogenetic Relationships between Four Salix L. Species Based on DArT Markers. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 24113-24125. https://doi.org/10.3390/ijms141224113
Gramlich S., Sagmeister P., Dullinger S., Hadacek F. & Hörandl E. (2016): Evolution in situ: hybrid origin and establishment of willows (Salix L.) on alpine glacier forefields. – Heredity 116: 521-541.
Seznam doporučené literatury
Vašut R. J., Sochor M., Hroneš M., Brandová B., Klečková L., Nývltová V. & Ševčík J. (2013): Vrby české republiky. – Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc. ISBN 978-80-244-4121-4.
Santamour F. S. & McArdle A. J. (1988): Cultivars of Salix babylonica and other Weeping Willows. – Journal of Arboriculture 14: 180-184.
Jaccoud D, Peng KM, Feinstein D, Kilian A (2001): Diversity Arrays: a solid state technology for sequence information independent genotyping. – Nucleic Acid Research 29: e25 (DOI: 10.1093/nar/29.4.e25).
Przyborowski, J.A.; Sulima, P.; Kuszewska, A.; Załuski, D.; Kilian, A. (2013): Phylogenetic Relationships between Four Salix L. Species Based on DArT Markers. Int. J. Mol. Sci. 2013, 14, 24113-24125. https://doi.org/10.3390/ijms141224113
Gramlich S., Sagmeister P., Dullinger S., Hadacek F. & Hörandl E. (2016): Evolution in situ: hybrid origin and establishment of willows (Salix L.) on alpine glacier forefields. – Heredity 116: 521-541.