Blumeria graminis způsobující chorobu padlí travní u hospodářských rostlin je významným škůdcem ječmene a dalších významných plodin. Rostliny si proti tomuto patogenu vyvinuly specifickou imunitu, díky které dokáží zastavit proliferaci patogenu. Tato imunita je představována geny rezistence, které cílí na geny virulence patogenu v rámci hypotézy gen-proti-genu. Geny virulence, které jsou rozpoznávány genem rezistence, jsou označovány jako geny avirulence. Toto rozpoznání vede k hypersenzitivní odpovědi v místě napadení rostlin. Validace genů avirulence má velký význam pro produkci rezistentních odrůd ječmene. Metod validace je celá řada, v této práci je používána metoda VOX a listová abraze.
Annotation in English
Blumeria graminis, which causes powdery mildew in agricultural crops, is a significant pest of barley and other important crops. Plants have developed a specific immunity against this pathogen, thanks to which they can stop the proliferation of the pathogen. This immunity is represented by resistance genes which target the virulence genes of the pathogen in terms of the gene-for-gene hypothesis. Virulence genes that are recognized by a resistance gene are referred to as avirulence genes, and this recognition leads to a hypersensitive response at the site of plant infection. Validation of avirulence genes is of great importance to produce resistant barley varieties. There are many validation methods, in this work the VOX method and leaf abrasion are used.
Blumeria graminis způsobující chorobu padlí travní u hospodářských rostlin je významným škůdcem ječmene a dalších významných plodin. Rostliny si proti tomuto patogenu vyvinuly specifickou imunitu, díky které dokáží zastavit proliferaci patogenu. Tato imunita je představována geny rezistence, které cílí na geny virulence patogenu v rámci hypotézy gen-proti-genu. Geny virulence, které jsou rozpoznávány genem rezistence, jsou označovány jako geny avirulence. Toto rozpoznání vede k hypersenzitivní odpovědi v místě napadení rostlin. Validace genů avirulence má velký význam pro produkci rezistentních odrůd ječmene. Metod validace je celá řada, v této práci je používána metoda VOX a listová abraze.
Annotation in English
Blumeria graminis, which causes powdery mildew in agricultural crops, is a significant pest of barley and other important crops. Plants have developed a specific immunity against this pathogen, thanks to which they can stop the proliferation of the pathogen. This immunity is represented by resistance genes which target the virulence genes of the pathogen in terms of the gene-for-gene hypothesis. Virulence genes that are recognized by a resistance gene are referred to as avirulence genes, and this recognition leads to a hypersensitive response at the site of plant infection. Validation of avirulence genes is of great importance to produce resistant barley varieties. There are many validation methods, in this work the VOX method and leaf abrasion are used.
Zpracování literární rešerše pro DP, vyhodnocení výsledků a jejich interpretace.
Recommended resources
Cheng et al.: Genetic Transformation of Wheat Mediated by Agrobacterium tumefaciens. Plant Physiol. (1997) 115: 971-980
Hensel et al.: Transgene expression systems in the Triticeae cereals. Journal of Plant Physiology 168 (2011) 30–44
Čermák et al.: A Multi-purpose Toolkit to Enable Advanced Genome Engineering in Plants. Plant Cell Advance Publication, 2017, doi:10.1105/tpc.16.00922
Cheuk and Houde : A rapid and efficient method for uniform gene expression using the barley stripe mosaic virus. Plant Methods, 2017, DOI 10.1186/s13007-017-0175-5
Recommended resources
Cheng et al.: Genetic Transformation of Wheat Mediated by Agrobacterium tumefaciens. Plant Physiol. (1997) 115: 971-980
Hensel et al.: Transgene expression systems in the Triticeae cereals. Journal of Plant Physiology 168 (2011) 30–44
Čermák et al.: A Multi-purpose Toolkit to Enable Advanced Genome Engineering in Plants. Plant Cell Advance Publication, 2017, doi:10.1105/tpc.16.00922
Cheuk and Houde : A rapid and efficient method for uniform gene expression using the barley stripe mosaic virus. Plant Methods, 2017, DOI 10.1186/s13007-017-0175-5
Enclosed appendices
-
Appendices bound in thesis
-
Taken from the library
Yes
Full text of the thesis
Appendices
Reviewer's report
Supervisor's report
Defence procedure record
Obhajobu diplomové práce studentky Bc. Kláry Ajglové zahájil prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. Studentka seznámila komisi s hlavními částmi a výsledky své práce. Následovalo přečtení posudků vedoucího práce Mgr. Miroslava Valárika, Ph.D. a oponenta RNDr. Jana Šafáře, Ph.D.
Studentka pak reagovala na připomínky a dotazy.
Prezentace studentky obsahovala tato témata:
cíle práce
interakce patogen vs. Hostitel, geny virulence a rezistence
gen avirulence AVRa1
BaSMV vektor – čtyřjednotková varianta, reportérový genm iLOV; metodika tvorby jejich konstruktu a jeho agroinfiltrace do rostliny
agroinfiltrace ječmene, nefunkčnost zvoleného systému s použitím reportérového genu iLOV
V rozpravě byly uvedeny následující připomínky či nastoleny tyto problémy:
zajímavé téma, zvládnuta velká škála použitých metodických postupů
horší jazyková úroveň literárního přehledu, příliš velké použití zkratek
mechanismus apoptózy u rostlin, existence SOG1 transkripčního faktoru a jeho funkce (srovnatelná s p53 u proteinu), zapojení v regulaci imunitní odpovědi a rezistence proti houbovým patogenů
výhody a nevýhody vícejednotkových virů/virových vektorů
metody funkční validace genů rostlin, přímá genetika, reverzní genetika
důvody použití iLOV namísto GFP, příklady dalších reportérových genů a detekce přítomnosti viru v hostiteli
Woroninova tělíska
vztah efektorů a R-genů, exprese R genů v rostlině
problém detekce iLOV signálu, vliv autoflorescence chlorofylu
Studentka na dotazy položené oponentem práce a členy komise reagovala pohotově, adekvátně se znalostí prezentované problematiky.