Metoda průtokové cytometrie byla využita pro stanovení absolutní a relativní velikosti genomu a stanovení DNA-ploidní úrovně u taxonů rodu Salix podrod Salix se zaměřením na skupinu smutečních vrb. Z celkových 97 analyzovaných vzorků byla nejmenší hodnota absolutní velikosti genomu naměřena u diploidního poddruhu S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Naopak největší absolutní velikost genomu byla zjištěna u hexaploidního druhu S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). Po porovnání nejmenší hodnoty obsahu jaderné DNA a největší hodnoty obsahu jaderné DNA bylo zjištěno, že se od sebe hodnoty liší 4násobně. DNA-ploidní úrovně u podrodu Salix byly zjištěny od diploidní po hexaploidní úroveň s tím, že tetraploidní úroveň byla převládající. Získané výsledky mohou doplnit databázi mapování genomů, která slouží pro vzájemné porovnání rostlinných genomů při zjišťování absolutní velikosti genomu u krytosemenných rostlin. U některých případů se jedná o vůbec první informace ohledně velikosti genomu u určitých druhů, kříženců nebo kultivarů.
Anotace v angličtině
The method of flow cytometry has been used to determine absolute and relative size of genome size and also to determine DNA-ploidy level for taxons of genus Salix subgen. Salix with special emphasis on weeping willow trees. From all the 97 analysed samples the lowest absolute genome size value has been measured / detected at diploid subsp. S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Contrarily the highest absolute genome size value has been detected at hexaploid species S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). After comparing the values of the smallest nuclear DNA content and of the biggest nuclear DNA discovery has been made with the finding that the values differ 4 times. DNA-ploidy level at Salix subgen. Salix were detected from diploid to hexaploid level with the conclusion that the tetraploid level was the predominant one. The results which has been obtained might supplement the database for genome mapping, that serves for reciprocal comparison of vegetal genomes when investigating the absolute size of the genom with angiosperm plants. At some case this is the very first information concerning the genom size of some specific varieties, hybrids or cultivars.
Klíčová slova
hybridizace, polyploidie, průtoková cytometrie, Salicaceae, velikost
genomu
Metoda průtokové cytometrie byla využita pro stanovení absolutní a relativní velikosti genomu a stanovení DNA-ploidní úrovně u taxonů rodu Salix podrod Salix se zaměřením na skupinu smutečních vrb. Z celkových 97 analyzovaných vzorků byla nejmenší hodnota absolutní velikosti genomu naměřena u diploidního poddruhu S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Naopak největší absolutní velikost genomu byla zjištěna u hexaploidního druhu S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). Po porovnání nejmenší hodnoty obsahu jaderné DNA a největší hodnoty obsahu jaderné DNA bylo zjištěno, že se od sebe hodnoty liší 4násobně. DNA-ploidní úrovně u podrodu Salix byly zjištěny od diploidní po hexaploidní úroveň s tím, že tetraploidní úroveň byla převládající. Získané výsledky mohou doplnit databázi mapování genomů, která slouží pro vzájemné porovnání rostlinných genomů při zjišťování absolutní velikosti genomu u krytosemenných rostlin. U některých případů se jedná o vůbec první informace ohledně velikosti genomu u určitých druhů, kříženců nebo kultivarů.
Anotace v angličtině
The method of flow cytometry has been used to determine absolute and relative size of genome size and also to determine DNA-ploidy level for taxons of genus Salix subgen. Salix with special emphasis on weeping willow trees. From all the 97 analysed samples the lowest absolute genome size value has been measured / detected at diploid subsp. S. triandra subsp. triandra (2C = 0,711 pg). Contrarily the highest absolute genome size value has been detected at hexaploid species S. 'Sacramento' (2C = 2,529 pg). After comparing the values of the smallest nuclear DNA content and of the biggest nuclear DNA discovery has been made with the finding that the values differ 4 times. DNA-ploidy level at Salix subgen. Salix were detected from diploid to hexaploid level with the conclusion that the tetraploid level was the predominant one. The results which has been obtained might supplement the database for genome mapping, that serves for reciprocal comparison of vegetal genomes when investigating the absolute size of the genom with angiosperm plants. At some case this is the very first information concerning the genom size of some specific varieties, hybrids or cultivars.
Klíčová slova
hybridizace, polyploidie, průtoková cytometrie, Salicaceae, velikost
genomu
Literární rešerše ke studované problematice (taxonomie smutečních vrb, velikost genomu u vrb)
Laboratorní výzkum: stanovení velikosti genomu vybraných zástupců Salix subgen. Salix (S. babylonica agg., S. alba, S. fragilis auct.).
Vyhodnocení výsledků, jejich shrnutí a interpretace
Zásady pro vypracování
Literární rešerše ke studované problematice (taxonomie smutečních vrb, velikost genomu u vrb)
Laboratorní výzkum: stanovení velikosti genomu vybraných zástupců Salix subgen. Salix (S. babylonica agg., S. alba, S. fragilis auct.).
Vyhodnocení výsledků, jejich shrnutí a interpretace
Seznam doporučené literatury
Belyaeva I. V., Epantchintseva O. V., Govaerts R. H. A., McGinn K., Hunnex J. & Kuzovkina Y. A. (2018): The application of scientific names to plants in cultivation: Salix vitellina L. and related taxa (Salicaceae). – Skvortsovia 4: 42-70.
Doležel J. & Bartoš J. (2005): Plant DNA Flow Cytometry and Estimation of Nuclear Genome Size. – Annals of Botany 95: 99-110.
Santamour F. S. & McArdle A. J. (1988): Cultivars of Salix babylonica and other Weeping Willows. – Journal of Arboriculture 14: 180-184.
Thibault J. (1998): Nuclear DNA amount in pure species and hybrid willows (Salix): a flow cytometric investigation. – Canadian Journal of Botany 76: 157-165.
Vašut R. J., Sochor M., Hroneš M., Brandová B., Klečková L., Nývltová V. & Ševčík J. (2013): Vrby České republiky. – Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc. ISBN 978-80-244-4121-4.
Seznam doporučené literatury
Belyaeva I. V., Epantchintseva O. V., Govaerts R. H. A., McGinn K., Hunnex J. & Kuzovkina Y. A. (2018): The application of scientific names to plants in cultivation: Salix vitellina L. and related taxa (Salicaceae). – Skvortsovia 4: 42-70.
Doležel J. & Bartoš J. (2005): Plant DNA Flow Cytometry and Estimation of Nuclear Genome Size. – Annals of Botany 95: 99-110.
Santamour F. S. & McArdle A. J. (1988): Cultivars of Salix babylonica and other Weeping Willows. – Journal of Arboriculture 14: 180-184.
Thibault J. (1998): Nuclear DNA amount in pure species and hybrid willows (Salix): a flow cytometric investigation. – Canadian Journal of Botany 76: 157-165.
Vašut R. J., Sochor M., Hroneš M., Brandová B., Klečková L., Nývltová V. & Ševčík J. (2013): Vrby České republiky. – Vydavatelství Univerzity Palackého v Olomouci, Olomouc. ISBN 978-80-244-4121-4.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
ilustrace, grafy, tabulky
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodu obhajoby studentka blíže představila vrby, a to konkrétně smuteční vrby, kterými se ve své práci zabývala. Dále popsala cíle své práce a metodiku. Výsledky interpretovala pomocí tabulek a grafů a na závěr je shrnula.
Vedoucí práce ocenil obsáhlost zkoumaného materiálu, pečlivost a samostatnost studentky. Kritizoval nedostatek času na zpracování, formální nedostatky a s nimi i často nemotorný text. Práce je podle něj nemalého vědeckého významu. Poté položil několik doplňujících otázek, na které studentka odpověděla dostatečně.
Oponent ocenil studentku za odvedenou práci v laboratoři, rozsáhlé představení taxonů v úvodu a zajímavé výsledky, které však potřebovaly lepší uchopení a zobrazení. Data jsou spoře prezentovaná, chybí vysvětlivky grafů, statistické zpracování a shrnutí pro jednotlivé taxony. Podle něj je práce nedostatečná po formální a stylistické stránce, mnohdy se objevovaly zavádějící informace, nedostatečná terminologie nebo chybné citace. Taktéž diskuze a literatura, z které studentka čerpala mohly být obsáhlejší. Na doplňující otázky oponenta studentka odpověděla nedostatečně.