Genóm diploidnej pšenice jednozrnky (T. monococcum) je vysoko kolineárný s Au genómom hexaploidnej pšenice siatej. Malý genóm pšenice jednozrnky a v prírode zachovaná genetická variabilita z nej robia dobrý model pre detekciu lokusov významných agronomických znakov, ktoré majú vplyv na výnos. Výnos je komplexný znak ovplyvnený jeho mnohými komponentami a vonkajším prostredím. Tvar zrna silne koreluje s jeho veľkosťou a ovplyvňuje výnos. Experimentálna časť tejto práce sa zamerala na mendelizáciu lokusu pre tvar zrna na chromozóme 7Am. K tomuto boli navrhnuté markery ohraničujúce jednotlivé detegované lokusy na ostatných chromozómoch a následne bolo vybraných 21 línií vhodných pre mapovanie lokusu pre tvar zrna s vysokým rozlíšením. Oblasť lokusu na chromozóme 7Am bola zároveň zahustená 15 kodominantnými markermi.
Anotace v angličtině
The genome of diploid einkorn wheat (T. monococcum) is highly collinear with the Au genome of hexaploid common wheat. Einkorn's small genome and conserved genetic variability in nature make it a good model for detecting loci of significant agronomic traits that affect yield. Yield is a complex trait influenced by its many components and the external environment. Grain shape strongly correlates with grain size and affects the yield. The experimental part of this work focused on mendelization of the grain shape locus on chromosome 7Am. For this, markers were designed to delimit the individual detected loci on other chromosomes, and then 21 lines suitable for high-resolution mapping of the grain shape locus were selected. The locus region on chromosome 7Am was also saturated with 15 codominant markers.
Klíčová slova
pšenica, Triticum monococcum, tvar zrna, veľkosť zrna, QTL
Genóm diploidnej pšenice jednozrnky (T. monococcum) je vysoko kolineárný s Au genómom hexaploidnej pšenice siatej. Malý genóm pšenice jednozrnky a v prírode zachovaná genetická variabilita z nej robia dobrý model pre detekciu lokusov významných agronomických znakov, ktoré majú vplyv na výnos. Výnos je komplexný znak ovplyvnený jeho mnohými komponentami a vonkajším prostredím. Tvar zrna silne koreluje s jeho veľkosťou a ovplyvňuje výnos. Experimentálna časť tejto práce sa zamerala na mendelizáciu lokusu pre tvar zrna na chromozóme 7Am. K tomuto boli navrhnuté markery ohraničujúce jednotlivé detegované lokusy na ostatných chromozómoch a následne bolo vybraných 21 línií vhodných pre mapovanie lokusu pre tvar zrna s vysokým rozlíšením. Oblasť lokusu na chromozóme 7Am bola zároveň zahustená 15 kodominantnými markermi.
Anotace v angličtině
The genome of diploid einkorn wheat (T. monococcum) is highly collinear with the Au genome of hexaploid common wheat. Einkorn's small genome and conserved genetic variability in nature make it a good model for detecting loci of significant agronomic traits that affect yield. Yield is a complex trait influenced by its many components and the external environment. Grain shape strongly correlates with grain size and affects the yield. The experimental part of this work focused on mendelization of the grain shape locus on chromosome 7Am. For this, markers were designed to delimit the individual detected loci on other chromosomes, and then 21 lines suitable for high-resolution mapping of the grain shape locus were selected. The locus region on chromosome 7Am was also saturated with 15 codominant markers.
Klíčová slova
pšenica, Triticum monococcum, tvar zrna, veľkosť zrna, QTL
1. Navrhnutie molekulárnych markerov pre mendelizáciu lokusu pre veľkosť zrna na chromozóme 7Am.
2. Selekcia línií vhodných pre odvodenie rekombinantných línií.
3. Navrhnutie molekulárnych markerov pre saturáciu oblasti.
4. Spracovanie literárnej rešerše, vyhodnotenie výsledkov a ich interpretácia.
Zásady pro vypracování
1. Navrhnutie molekulárnych markerov pre mendelizáciu lokusu pre veľkosť zrna na chromozóme 7Am.
2. Selekcia línií vhodných pre odvodenie rekombinantných línií.
3. Navrhnutie molekulárnych markerov pre saturáciu oblasti.
4. Spracovanie literárnej rešerše, vyhodnotenie výsledkov a ich interpretácia.
Seznam doporučené literatury
Yu, K., Liu, D., Chen, Y., Wang, D., Yang, W., Yang, W., Yin, L., Zhang, C., Zhao, S., Sun, J., Liu, C., & Zhang, A. (2019). Unraveling the genetic architecture of grain size in einkorn wheat through linkage and homology mapping and transcriptomic profiling. Journal of Experimental Botany, 70(18), 4671–4688.
Kumar, A., Mantovani, E. E., Seetan, R., Soltani, A., Echeverry-Solarte, M., Jain, S., Simsek, S., Doehlert, D., Alamri, M. S., Elias, E. M., Kianian, S. F., & Mergoum, M. (2016). Dissection of genetic factors underlying wheat kernel shape and size in an elite × nonadapted cross using a high density SNP linkage map. The Plant Genome, 9(1), plantgenome2015.09.0081.
Tian, J., Deng, Z., Zhang, K., Yu, H., & Jiang, X. (2015). Genetic analyses of wheat and molecular marker-assisted breeding. (Vol. 1). Springer.
Seznam doporučené literatury
Yu, K., Liu, D., Chen, Y., Wang, D., Yang, W., Yang, W., Yin, L., Zhang, C., Zhao, S., Sun, J., Liu, C., & Zhang, A. (2019). Unraveling the genetic architecture of grain size in einkorn wheat through linkage and homology mapping and transcriptomic profiling. Journal of Experimental Botany, 70(18), 4671–4688.
Kumar, A., Mantovani, E. E., Seetan, R., Soltani, A., Echeverry-Solarte, M., Jain, S., Simsek, S., Doehlert, D., Alamri, M. S., Elias, E. M., Kianian, S. F., & Mergoum, M. (2016). Dissection of genetic factors underlying wheat kernel shape and size in an elite × nonadapted cross using a high density SNP linkage map. The Plant Genome, 9(1), plantgenome2015.09.0081.
Tian, J., Deng, Z., Zhang, K., Yu, H., & Jiang, X. (2015). Genetic analyses of wheat and molecular marker-assisted breeding. (Vol. 1). Springer.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
tabulky
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajobu bakalářské práce studentky Alžbety Holbové zahájil prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. Studentka seznámila komisi s hlavními částmi a výsledky své práce. Následovalo přečtení posudku vedoucího práce Mgr. Adama Lampara a oponenta Mgr. Radima Svačiny, Ph.D. Studentka pak reagovala na připomínky a dotazy.
Prezentace studentky obsahovala tato témata:
- cíle práce
- pšenice jednozrnka (Triticum monococcum L.), její chrakteristika a důvody použití ve studii
- QTL analýza, identifikace významných genových lokusů genů zapojených ve tvaru zrna
- molekulární markery pro tvar zrna pšenice
- odvození rekombinantních linií, mendelizace QTL na chromozomu 7Am