Bakalářská práce je v teoretické části zaměřena na charakterizaci enzymové rodiny NADPH-oxidas (Nox) a duálních oxidas (Duox). V úvodu práce je stručně popsána duální role reaktivních forem kyslíku (ROS). Následující kapitoly se zabývají převážně molekulárními vlastnostmi Nox/Duox a jejich funkci v interakci střevního epitelu hmyzu s mikroby. V poslední části jsou shrnuty metody pro stanovení aktivity Nox/Duox v biologických systémech.
V experimentální části práce byla zaváděna fluorimetrická analýza pro stanovení aktivity Nox/Duox ve vzorcích včel medonosných nakažených různými patogeny. Pro detekci tvorby ROS ve střevech včel byla využita histochemická metoda s diaminobenzidinem. V neposlední řadě bylo zpracováno bioinformatické srovnání Nox/Duox octomilek a včel.
Anotace v angličtině
In the theoretical part, the thesis is focused on the characterization of NADPH-oxidases (Nox) and dual oxidases (Duox) protein family. At the beginning of the work there is a short description of the dual role of reactive oxygen species (ROS). Next chapters deal with the molecular properties of Nox/Duox and their function in the interaction of the gut epithelium with microbes. The last part summarizes the methods of measuring Nox/Duox activity in biological systems.
In the experimental part of the thesis, the fluorimetric assay for measurement of Nox/Duox activity in honeybees infected with different pathogens was introduced. For the detection of ROS production in the intestines of honeybees, a histochemical assay with diaminobenzidine was used. Last a bioinformatic comparison of Nox/Duox of fruit flies and honeybees was compiled.
Klíčová slova
Duální oxidasy, NADPH-oxidasy, octomilka obecná, reaktivní formy kyslíku, včela medonosná
Klíčová slova v angličtině
Dual oxidases, fruit fly, honeybee, NADPH-oxidases, reactive oxygen species
Rozsah průvodní práce
61 s.
Jazyk
CZ
Anotace
Bakalářská práce je v teoretické části zaměřena na charakterizaci enzymové rodiny NADPH-oxidas (Nox) a duálních oxidas (Duox). V úvodu práce je stručně popsána duální role reaktivních forem kyslíku (ROS). Následující kapitoly se zabývají převážně molekulárními vlastnostmi Nox/Duox a jejich funkci v interakci střevního epitelu hmyzu s mikroby. V poslední části jsou shrnuty metody pro stanovení aktivity Nox/Duox v biologických systémech.
V experimentální části práce byla zaváděna fluorimetrická analýza pro stanovení aktivity Nox/Duox ve vzorcích včel medonosných nakažených různými patogeny. Pro detekci tvorby ROS ve střevech včel byla využita histochemická metoda s diaminobenzidinem. V neposlední řadě bylo zpracováno bioinformatické srovnání Nox/Duox octomilek a včel.
Anotace v angličtině
In the theoretical part, the thesis is focused on the characterization of NADPH-oxidases (Nox) and dual oxidases (Duox) protein family. At the beginning of the work there is a short description of the dual role of reactive oxygen species (ROS). Next chapters deal with the molecular properties of Nox/Duox and their function in the interaction of the gut epithelium with microbes. The last part summarizes the methods of measuring Nox/Duox activity in biological systems.
In the experimental part of the thesis, the fluorimetric assay for measurement of Nox/Duox activity in honeybees infected with different pathogens was introduced. For the detection of ROS production in the intestines of honeybees, a histochemical assay with diaminobenzidine was used. Last a bioinformatic comparison of Nox/Duox of fruit flies and honeybees was compiled.
Klíčová slova
Duální oxidasy, NADPH-oxidasy, octomilka obecná, reaktivní formy kyslíku, včela medonosná
Klíčová slova v angličtině
Dual oxidases, fruit fly, honeybee, NADPH-oxidases, reactive oxygen species
Zásady pro vypracování
Vypracovat literární rešerši shrnující aktuální poznatky o vlastnostech, funkci a významu NADPH-oxidas (Nox) a duálních oxidas (Duox) v metabolismu reaktivních forem kyslíku (ROS)
Zpracovat souhrn spektrofotometrických a histochemických metod stanovení aktivity Nox/Duox ve vzorcích střev včel a octomilek
Srovnání orthologních Nox a Duox včel a octomilek pomocí in silico metod
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce na oboru Biochemie PřF UP uvedeným na webové stránce Katedry biochemie .https://www.prf.upol.cz/katedra-biochemie/studium/bakalarske-a-diplomove-prace/
Práce bude studentem nejdříve vložena v elektronické podobě ve formátu pdf do systému STAG a doplněna povinnými údaji o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení
Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci), a to v řádném termínu uvedeném v harmonogramu na webové stránce Oddělení buněčné biologie CRH.http://cr-hana.upol.cz/cellbiol/
Odevzdání závěrečné práce na sekretariátě Oddělení buněčné biologie CRH ve dvou svázaných výtiscích obsahujících CD s elektronickou verzí závěrečné práce proběhne v termínu uvedeném v Pokynech pro odevzdávání prací
na webové stránce Oddělení buněčné biologie CRH.http://cr-hana.upol.cz/cellbiol/
Zásady pro vypracování
Vypracovat literární rešerši shrnující aktuální poznatky o vlastnostech, funkci a významu NADPH-oxidas (Nox) a duálních oxidas (Duox) v metabolismu reaktivních forem kyslíku (ROS)
Zpracovat souhrn spektrofotometrických a histochemických metod stanovení aktivity Nox/Duox ve vzorcích střev včel a octomilek
Srovnání orthologních Nox a Duox včel a octomilek pomocí in silico metod
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce na oboru Biochemie PřF UP uvedeným na webové stránce Katedry biochemie .https://www.prf.upol.cz/katedra-biochemie/studium/bakalarske-a-diplomove-prace/
Práce bude studentem nejdříve vložena v elektronické podobě ve formátu pdf do systému STAG a doplněna povinnými údaji o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení
Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci), a to v řádném termínu uvedeném v harmonogramu na webové stránce Oddělení buněčné biologie CRH.http://cr-hana.upol.cz/cellbiol/
Odevzdání závěrečné práce na sekretariátě Oddělení buněčné biologie CRH ve dvou svázaných výtiscích obsahujících CD s elektronickou verzí závěrečné práce proběhne v termínu uvedeném v Pokynech pro odevzdávání prací
na webové stránce Oddělení buněčné biologie CRH.http://cr-hana.upol.cz/cellbiol/
Seznam doporučené literatury
Kawahara T et al. (2007) Molecular evolution of the reactive oxygen-generating NADPH oxidase (Nox/Duox) family of enzymes. BMC Evolutionary Biology 7:109
Lee KA et al. (2013) Bacterial-Derived Uracil as a Modulator of Mucosal Immunity and Gut-Microbe Homeostasis in Drosophila. Cell 153, 797?811
Patel PH et al. (2013) Stimulating cROSstalk between commensal bacteria and intestinal stem cells. The EMBO Journal 32, 3009?3010
Rada B, Leto T (2008) Oxidative Innate Immune Defenses by Nox/Duox Family NADPH Oxidases. In Egesten A, Schmidt A, Herwald H (eds): Trends in Innate Immunity.Contrib Microbiol. Basel, Karger, 2008, vol 15, pp 164?187
Seznam doporučené literatury
Kawahara T et al. (2007) Molecular evolution of the reactive oxygen-generating NADPH oxidase (Nox/Duox) family of enzymes. BMC Evolutionary Biology 7:109
Lee KA et al. (2013) Bacterial-Derived Uracil as a Modulator of Mucosal Immunity and Gut-Microbe Homeostasis in Drosophila. Cell 153, 797?811
Patel PH et al. (2013) Stimulating cROSstalk between commensal bacteria and intestinal stem cells. The EMBO Journal 32, 3009?3010
Rada B, Leto T (2008) Oxidative Innate Immune Defenses by Nox/Duox Family NADPH Oxidases. In Egesten A, Schmidt A, Herwald H (eds): Trends in Innate Immunity.Contrib Microbiol. Basel, Karger, 2008, vol 15, pp 164?187
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
grafy, schémata, tabulky
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodu obhajoby předseda komise prof. Mgr. Miroslav Ovečka, Ph.D. představil studenta přítomným akademickým pracovníkům a hostům. V rámci prezentace své práce student seznámil všechny zúčastněné s cíli práce a hlavními metodami využitými při jejím zpracování, dále se získanými výsledky a z nich vyplývajícími závěry.
Následně byl přečten posudek vedoucího práce a oponentní posudek. Odpovědi na otázky a připomínky uvedené v posudku vedoucího bakalářské práce a oponenta student zodpověděl.