Bakalářská práce je věnována morfologickým znakům sóji luštinaté (Glycine max), konkrétně hustotě trichomů a postavení trichomů vůči listu. V teoretické části práce je stručně představena sója luštinatá a následně jsou popsány trichomy se zaměřením na sóju. Dále je zmíněn vývoj, vlastnosti a přínos trichomů pro rostliny a jejich důležitost při pěstování sóji. Cílem praktické části je předpovědět a ověřit kandidátní geny pro postavení trichomů vůči listu. Pomocí veřejně přístupných internetových nástrojů byla zpracována data, která vedla k ověření kandidátních genů na chromosomu 12, kde je přítomna alela Pa1 a chromosomu 13, kde se nachází alela Pa2. Tyto dvě alely jsou zodpovědné za fenotypový projev postavení trichomů vůči listu. Pro chromosom 12 jsou potenciálními kandidátními geny Glyma.12g213800 a Glyma.12g213900 a pro chromosom 13 je kandidátním genem Glyma.13g204900.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis is devoted to morphological traits of soybean (Glycine max) specified on trichome density and trichome formation. Theoretical part of the thesis gives brief introduction of information about soybean and its trichomes. Development, features, and benefits of trichomes are mentioned next. The goal of practical part is to predict and verify candidate genes responsible for trichome formation. Data were analyzed by online bioinformatics tools with aim to verify candidate genes on chromosome 12, where Pa1 allele is located and on chromosome 13, where is located Pa2 allele. These two alleles are resposible for trichome formation. Glyma.12g213800 and Glyma.12g213900 are possible candidate genes for chromosome 12 and Glyma.13g204900 is candidate gene for chromsome 13.
Klíčová slova
Sója luštinatá, Glycine max, trichomy, postavení trichomů vůči listu, přirozená genetická variabilita, bioinformatické nástroje
Bakalářská práce je věnována morfologickým znakům sóji luštinaté (Glycine max), konkrétně hustotě trichomů a postavení trichomů vůči listu. V teoretické části práce je stručně představena sója luštinatá a následně jsou popsány trichomy se zaměřením na sóju. Dále je zmíněn vývoj, vlastnosti a přínos trichomů pro rostliny a jejich důležitost při pěstování sóji. Cílem praktické části je předpovědět a ověřit kandidátní geny pro postavení trichomů vůči listu. Pomocí veřejně přístupných internetových nástrojů byla zpracována data, která vedla k ověření kandidátních genů na chromosomu 12, kde je přítomna alela Pa1 a chromosomu 13, kde se nachází alela Pa2. Tyto dvě alely jsou zodpovědné za fenotypový projev postavení trichomů vůči listu. Pro chromosom 12 jsou potenciálními kandidátními geny Glyma.12g213800 a Glyma.12g213900 a pro chromosom 13 je kandidátním genem Glyma.13g204900.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis is devoted to morphological traits of soybean (Glycine max) specified on trichome density and trichome formation. Theoretical part of the thesis gives brief introduction of information about soybean and its trichomes. Development, features, and benefits of trichomes are mentioned next. The goal of practical part is to predict and verify candidate genes responsible for trichome formation. Data were analyzed by online bioinformatics tools with aim to verify candidate genes on chromosome 12, where Pa1 allele is located and on chromosome 13, where is located Pa2 allele. These two alleles are resposible for trichome formation. Glyma.12g213800 and Glyma.12g213900 are possible candidate genes for chromosome 12 and Glyma.13g204900 is candidate gene for chromsome 13.
Klíčová slova
Sója luštinatá, Glycine max, trichomy, postavení trichomů vůči listu, přirozená genetická variabilita, bioinformatické nástroje
Sója luštinatá Glycine max [L.] Merr. je komodita celosvětového významu a poptávka po ní se neustále zvyšuje. Díky tomu je sójou osívána stále větší zemědělská plocha a to ve všech zeměpisných šířkách momentálně vhodných k pěstování. Mezi agronomicky důležité znaky pro tvorbu nových kultivarů sóji patří i hustota trichomů, jejich postavení vůči listu, délka, zakončení nebo jejich úplná nepřítomnost. Variety sóji s vysokou hustotou trichomů jsou odolnější vůči suchu a patogenům. Ačkoli alely pro různé postavení trichomů vůči listu jsou v genomu sóji mapovány, konkrétní geny doposud identifikovány nebyly. Cílem teoretické části bakalářské práce je vypracovat rešerši na téma morfologie trichomů jako důležitý agronomický znak sóji. Praktická část si klade za cíl navrhnout a případně i ověřit kandidátní geny zodpovědné za vzpřímený/částečně přilehlý/přilehlý fenotyp postavení trichomů vůči listu.
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce na oboru Biochemie PřF UP uvedeným na webové stránce Katedry biochemie (http://biochemie.upol.cz/index.php/cs/studium/zaverecne-prace).
Vzhledem k aktuálnímu nastavenému režimu na UP v souvislosti s pandemií Covid-19 v době odevzdání závěrečných prací ve školním roce 2020/2021 je student povinen vložit ekvivalentní elektronickou podobu závěrečné práce do systému STAG a doplnit povinné údaje o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci).
Student odevzdá dva svázané výtisky závěrečné práce přímo zkušební komisi v den obhajoby. Vzhledem k omezeným možnostem vypalování nemusí být CD s elektronickou verzí součástí BP.
Zásady pro vypracování
Sója luštinatá Glycine max [L.] Merr. je komodita celosvětového významu a poptávka po ní se neustále zvyšuje. Díky tomu je sójou osívána stále větší zemědělská plocha a to ve všech zeměpisných šířkách momentálně vhodných k pěstování. Mezi agronomicky důležité znaky pro tvorbu nových kultivarů sóji patří i hustota trichomů, jejich postavení vůči listu, délka, zakončení nebo jejich úplná nepřítomnost. Variety sóji s vysokou hustotou trichomů jsou odolnější vůči suchu a patogenům. Ačkoli alely pro různé postavení trichomů vůči listu jsou v genomu sóji mapovány, konkrétní geny doposud identifikovány nebyly. Cílem teoretické části bakalářské práce je vypracovat rešerši na téma morfologie trichomů jako důležitý agronomický znak sóji. Praktická část si klade za cíl navrhnout a případně i ověřit kandidátní geny zodpovědné za vzpřímený/částečně přilehlý/přilehlý fenotyp postavení trichomů vůči listu.
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce na oboru Biochemie PřF UP uvedeným na webové stránce Katedry biochemie (http://biochemie.upol.cz/index.php/cs/studium/zaverecne-prace).
Vzhledem k aktuálnímu nastavenému režimu na UP v souvislosti s pandemií Covid-19 v době odevzdání závěrečných prací ve školním roce 2020/2021 je student povinen vložit ekvivalentní elektronickou podobu závěrečné práce do systému STAG a doplnit povinné údaje o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci).
Student odevzdá dva svázané výtisky závěrečné práce přímo zkušební komisi v den obhajoby. Vzhledem k omezeným možnostem vypalování nemusí být CD s elektronickou verzí součástí BP.
Seznam doporučené literatury
Gilbert, 2017
Bandillo et al., 2017
Liu et al., 2020
Seznam doporučené literatury
Gilbert, 2017
Bandillo et al., 2017
Liu et al., 2020
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
tabulky
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodu obhajoby předsedkyně komise doc. RNDr. Lenka Luhová, Ph.D. představila studentku přítomným akademickým pracovníkům a hostům. V rámci prezentace své práce Postavení trichomů vůči listu jako důležitý agronomický znak sóji luštinaté Glycine max [L.] Merr. studentka seznámila všechny zúčastněné s cíli práce a hlavními metodami využitými při jejím zpracování, dále se získanými výsledky a z nich vyplývajícími závěry.
Následně byl přečten posudek vedoucí práce a oponentský posudek. Studentka zodpověděla dotazy položené v posudku oponentky. Odpověděla také na dotazy členů zkušební komise:
prof. Petřivalský: Příprava vzorků pro PCR - proč FTA karty?
dr. Danihlík: Haploblok - co to je?
Z důvodu pozitivního výsledku SARS-CoV-2 (COVID19) obhajoba proběhla online formou.