Tato diplomová práce byla zaměřena
na analýzu krevních vzorků pacientů
s karcinomem prostaty, kdy byla sledována
exprese vybraných genů z krevní plazmy a
cirkulujících nádorových buněk pomocí
RT-qPCR. Byla zjištěna vyšší efektivita
použití cfDNA/RNA oproti CTCs a byl
prokázán signifikantní vztah mezi vyšší
expresí AMACR, kratší dobou užívání ARTA
terapie a vyšší úmrtností pacientů. Vedle
zavedených klinických parametrů může
tekutá biopsie přispět k lepšímu monitoringu
stavu pacienta a zpřesnit predikci jeho
odpovědi na léčbu.
Anotace v angličtině
This diploma thesis was focused
on analysis of blood samples from patients
with prostate carcinoma. The expression of
selected genes was monitored from blood
plasma and circulating tumor cells using
RT-qPCR. Analysis of cfDNA/RNA was
more efficient in comparison to CTCs. High
expression of AMACR was significantly
associated with shorter time of ARTA
therapy and higher mortality of patients.
Besides established clinical parameters, the
liquid biopsy can improve disease
monitoring and prediction of therapy
response.
Tato diplomová práce byla zaměřena
na analýzu krevních vzorků pacientů
s karcinomem prostaty, kdy byla sledována
exprese vybraných genů z krevní plazmy a
cirkulujících nádorových buněk pomocí
RT-qPCR. Byla zjištěna vyšší efektivita
použití cfDNA/RNA oproti CTCs a byl
prokázán signifikantní vztah mezi vyšší
expresí AMACR, kratší dobou užívání ARTA
terapie a vyšší úmrtností pacientů. Vedle
zavedených klinických parametrů může
tekutá biopsie přispět k lepšímu monitoringu
stavu pacienta a zpřesnit predikci jeho
odpovědi na léčbu.
Anotace v angličtině
This diploma thesis was focused
on analysis of blood samples from patients
with prostate carcinoma. The expression of
selected genes was monitored from blood
plasma and circulating tumor cells using
RT-qPCR. Analysis of cfDNA/RNA was
more efficient in comparison to CTCs. High
expression of AMACR was significantly
associated with shorter time of ARTA
therapy and higher mortality of patients.
Besides established clinical parameters, the
liquid biopsy can improve disease
monitoring and prediction of therapy
response.
1) Vypracování literární rešerše na téma Tekutá biopsie a monitoring pokročilého
karcinomu prostaty.
2) Izolace nukleových kyselin z krve pacientů s karcinomem prostaty, jak z
cirkulujících nádorových buněk, tak z plazmy (cirkulující nádorová DNA).
3) Expresní a mutační analýza vybraných cílů (např. TMPRSS2-ERG, p53 a varianty
androgenového receptoru).
4) Zhodnocení klinického významu provedených analýz.
Zásady pro vypracování
1) Vypracování literární rešerše na téma Tekutá biopsie a monitoring pokročilého
karcinomu prostaty.
2) Izolace nukleových kyselin z krve pacientů s karcinomem prostaty, jak z
cirkulujících nádorových buněk, tak z plazmy (cirkulující nádorová DNA).
3) Expresní a mutační analýza vybraných cílů (např. TMPRSS2-ERG, p53 a varianty
androgenového receptoru).
4) Zhodnocení klinického významu provedených analýz.
Seznam doporučené literatury
1) Stein MN, Jang TL. Striving Toward a Cure for Prostate Cancer. J Clin Oncol.
2016 Jun 20;34(18.
2) Annala M, Vandekerkhove G, Khalaf D, Taavitsainen S, Beja K, Warner EW,
Sunderland K, Kollmannsberger C, Eigl BJ, Finch D, Oja CD, Vergidis J,
Zulfiqar M, Azad AA, Nykter M, Gleave ME, Wyatt AW, Chi KN. Circulating
Tumor DNA Genomics Correlate with Resistance to Abiraterone and Enzalutamide
in Prostate Cancer. Cancer Discov. 2018 Apr;8(4):444-457.
3) Conteduca V, Wetterskog D, Sharabiani MTA, Grande E, Fernandez-Perez MP,
Jayaram A, Salvi S, Castellano D, Romanel A, Lolli C, Casadio V, Gurioli G,
Amadori D, Font A, Vazquez-Estevez S, González Del Alba A, Mellado B,
Fernandez-Calvo O, Méndez-Vidal MJ, Climent MA, Duran I, Gallardo E,
Rodriguez A, Santander C, Sáez MI, Puente J, Gasi Tandefelt D, Wingate A,
Dearnaley D; PREMIERE Collaborators.; Spanish Oncology Genitourinary Group.,
Demichelis F, De Giorgi U, Gonzalez-Billalabeitia E, Attard G. Androgen
receptor gene status in plasma DNA associates with worse outcome on
enzalutamide or abiraterone for castration-resistant prostate cancer: a
multi-institution correlative biomarker study. Ann Oncol.
2017 Jul 1;28(7):1508-1516.
Seznam doporučené literatury
1) Stein MN, Jang TL. Striving Toward a Cure for Prostate Cancer. J Clin Oncol.
2016 Jun 20;34(18.
2) Annala M, Vandekerkhove G, Khalaf D, Taavitsainen S, Beja K, Warner EW,
Sunderland K, Kollmannsberger C, Eigl BJ, Finch D, Oja CD, Vergidis J,
Zulfiqar M, Azad AA, Nykter M, Gleave ME, Wyatt AW, Chi KN. Circulating
Tumor DNA Genomics Correlate with Resistance to Abiraterone and Enzalutamide
in Prostate Cancer. Cancer Discov. 2018 Apr;8(4):444-457.
3) Conteduca V, Wetterskog D, Sharabiani MTA, Grande E, Fernandez-Perez MP,
Jayaram A, Salvi S, Castellano D, Romanel A, Lolli C, Casadio V, Gurioli G,
Amadori D, Font A, Vazquez-Estevez S, González Del Alba A, Mellado B,
Fernandez-Calvo O, Méndez-Vidal MJ, Climent MA, Duran I, Gallardo E,
Rodriguez A, Santander C, Sáez MI, Puente J, Gasi Tandefelt D, Wingate A,
Dearnaley D; PREMIERE Collaborators.; Spanish Oncology Genitourinary Group.,
Demichelis F, De Giorgi U, Gonzalez-Billalabeitia E, Attard G. Androgen
receptor gene status in plasma DNA associates with worse outcome on
enzalutamide or abiraterone for castration-resistant prostate cancer: a
multi-institution correlative biomarker study. Ann Oncol.
2017 Jul 1;28(7):1508-1516.