Bakalárska práca bola zameraná na štúdium sezónnej dynamiky a infikovanosti kliešťov Ixodes ricinus vybranými druhmi patogénov na modelovej lokalite Slanské vrchy. Kliešť obyčajný patrí medzi najvýznamnejšie druhy kliešťov na území Slovenska, ako aj celej Európy. V prírode zabezpečuje prenos a cirkuláciu patogénov a plní tým úlohu vektora a v niektorých prípadoch aj rezervoára pôvodcov ochorení. V experimentálnej časti predloženej bakalárskej práce bol vykonaný zber kliešťov z vegetácie v období apríl-september 2016. Z kliešťov boli vytvorené pooly o zložení 5 dospelých jedincov alebo 10 nýmf. Následne z nich bola izolovaná RNA, ktorá potom bola prepísaná do cDNA pre PCR. Boli použité rodovo/druhovo špecifické primery pre detekciu patogénov Anaplasma phagocytophilum, Babesia spp. a Borrelia burgdorferi sensu lato. Vzorky celkovej RNA boli použité aj pre detekciu vírusu kliešťovej encefalitídy pomocou Real-time PCR. Vyšetrených bolo 606 kliešťov, z ktorých bolo vytvorených 68 poolov. Na prítomnosť baktérií z komplexu Borrelia burgdorferi s. l. bolo pozitívnych 29,41 % poolov. Druhým najviac zastúpeným patogénom vo vzorkách bol vírus kliešťovej encefalitídy, 16,18 % pozitívnych poolov. Anaplasma phagocytophilum a Babesia spp. boli prítomné obe v približne 11 % vyšetrených poolov.Sezónna dynamika výskytu kliešťa obyčajného na modelovej lokalite v roku 2016 bola jednovrcholová, s jarným vrcholom. Výskyt kliešťov bol potvrdený aj v najvyšších oblastiach zberu (870 m.n.m), kde sa v minulosti síce vyskytovali, avšak v oveľa nižších počtoch.Príčinou posúvania hranice výskytu kliešťov a nimi prenosných patogénov je pravdepodobne zmena klímy, ktorá spôsobuje zvyšovanie teplôt a tým umožňuje prežitie kliešťov a ich hostiteľov v predtým neprístupných oblastiach. Výskum potvrdil dôležitosť pravidelného lokálneho monitoringu kliešťov ako prostriedku pre zvýšenie efektívnosti preventívnych opatrení.
Anotace v angličtině
The bachelor thesis was focused on the study of seasonal dynamics and infection of Ixodes ricinus ticks with selected pathogen species on the Slanské vrchy model site. Ixodes ricinus is one of the most important tick species in Slovakia and Europe. In natural foci, ticks are responsible for transmission and circulation of pathogens and thereby act as a vectors and potential reservoirs of pathogenic agents. Within the experimental part of the bachelor thesis, ticks were collected from the vegetation in April-September 2016. Ticks were pooled with 5 adults or 10 nymphs. Subsequently, RNA was isolated and then transcribed into cDNA for PCR. The genera/species specific primers were used for the detection of Anaplasma phagocytophilum, Babesia spp., and Borrelia burgdorferi sensu lato pathogens. RNA samples were also used for detection of tick-borne encephalitis virus by means of Real-time PCR. In total 606 ticks were examined and 68 pools were created from them. For the presence of bacteria of the Borrelia burgdorferi s. l. complex 29.41 % of pools were positive. The second most prevalent pathogen in the samples was tick encephalitis virus detected in 16.18 % of pools. Both, Anaplasma phagocytophilum and Babesia spp. were present in approximately 11 % of examined pools.The seasonal dynamics of the Ixodes ricinus occurrence on the model site in 2016 was single-headed with one spring peak. The shift of infected ticks to sites with higher altitudes, where their presence in the past was much less frequent¸ was also confirmed.
The cause of the increase in tick and pathogen transmission is most likely the climate change, which causes the rise of temperatures that allow the survival of ticks and their hosts in previously unavailable areas. Research has confirmed the importance of regular local tick monitoring as an important tool to improve the effectiveness of preventive measures.
Bakalárska práca bola zameraná na štúdium sezónnej dynamiky a infikovanosti kliešťov Ixodes ricinus vybranými druhmi patogénov na modelovej lokalite Slanské vrchy. Kliešť obyčajný patrí medzi najvýznamnejšie druhy kliešťov na území Slovenska, ako aj celej Európy. V prírode zabezpečuje prenos a cirkuláciu patogénov a plní tým úlohu vektora a v niektorých prípadoch aj rezervoára pôvodcov ochorení. V experimentálnej časti predloženej bakalárskej práce bol vykonaný zber kliešťov z vegetácie v období apríl-september 2016. Z kliešťov boli vytvorené pooly o zložení 5 dospelých jedincov alebo 10 nýmf. Následne z nich bola izolovaná RNA, ktorá potom bola prepísaná do cDNA pre PCR. Boli použité rodovo/druhovo špecifické primery pre detekciu patogénov Anaplasma phagocytophilum, Babesia spp. a Borrelia burgdorferi sensu lato. Vzorky celkovej RNA boli použité aj pre detekciu vírusu kliešťovej encefalitídy pomocou Real-time PCR. Vyšetrených bolo 606 kliešťov, z ktorých bolo vytvorených 68 poolov. Na prítomnosť baktérií z komplexu Borrelia burgdorferi s. l. bolo pozitívnych 29,41 % poolov. Druhým najviac zastúpeným patogénom vo vzorkách bol vírus kliešťovej encefalitídy, 16,18 % pozitívnych poolov. Anaplasma phagocytophilum a Babesia spp. boli prítomné obe v približne 11 % vyšetrených poolov.Sezónna dynamika výskytu kliešťa obyčajného na modelovej lokalite v roku 2016 bola jednovrcholová, s jarným vrcholom. Výskyt kliešťov bol potvrdený aj v najvyšších oblastiach zberu (870 m.n.m), kde sa v minulosti síce vyskytovali, avšak v oveľa nižších počtoch.Príčinou posúvania hranice výskytu kliešťov a nimi prenosných patogénov je pravdepodobne zmena klímy, ktorá spôsobuje zvyšovanie teplôt a tým umožňuje prežitie kliešťov a ich hostiteľov v predtým neprístupných oblastiach. Výskum potvrdil dôležitosť pravidelného lokálneho monitoringu kliešťov ako prostriedku pre zvýšenie efektívnosti preventívnych opatrení.
Anotace v angličtině
The bachelor thesis was focused on the study of seasonal dynamics and infection of Ixodes ricinus ticks with selected pathogen species on the Slanské vrchy model site. Ixodes ricinus is one of the most important tick species in Slovakia and Europe. In natural foci, ticks are responsible for transmission and circulation of pathogens and thereby act as a vectors and potential reservoirs of pathogenic agents. Within the experimental part of the bachelor thesis, ticks were collected from the vegetation in April-September 2016. Ticks were pooled with 5 adults or 10 nymphs. Subsequently, RNA was isolated and then transcribed into cDNA for PCR. The genera/species specific primers were used for the detection of Anaplasma phagocytophilum, Babesia spp., and Borrelia burgdorferi sensu lato pathogens. RNA samples were also used for detection of tick-borne encephalitis virus by means of Real-time PCR. In total 606 ticks were examined and 68 pools were created from them. For the presence of bacteria of the Borrelia burgdorferi s. l. complex 29.41 % of pools were positive. The second most prevalent pathogen in the samples was tick encephalitis virus detected in 16.18 % of pools. Both, Anaplasma phagocytophilum and Babesia spp. were present in approximately 11 % of examined pools.The seasonal dynamics of the Ixodes ricinus occurrence on the model site in 2016 was single-headed with one spring peak. The shift of infected ticks to sites with higher altitudes, where their presence in the past was much less frequent¸ was also confirmed.
The cause of the increase in tick and pathogen transmission is most likely the climate change, which causes the rise of temperatures that allow the survival of ticks and their hosts in previously unavailable areas. Research has confirmed the importance of regular local tick monitoring as an important tool to improve the effectiveness of preventive measures.
1. Naštudovať dostupnú odbornú literatúru a vypracovať literárny prehľad súvisiaci s témou bakalárskej práce; zvládnuť metódy terénneho zberu a následného laboratórneho spracovania biologického materiálu (izolácia DNA,/RNA, RT - PCR)
2. Zistiť výskyt a sezónnu dynamiku kliešťov Ixodes ricinus a kliešťami-prenášaných patogénov na vybranej modelovej lokalite na východnom Slovensku
3. Zistiť druhovú diverzitu a prevalenciu DNA (Borrelia spp., Babesia spp., Anaplasma spp.) a RNA (vírus kliešťovej encefalitídy) patogénov v kliešťoch pomocou molekulovo-genetických metód na báze PCR
Zásady pro vypracování
1. Naštudovať dostupnú odbornú literatúru a vypracovať literárny prehľad súvisiaci s témou bakalárskej práce; zvládnuť metódy terénneho zberu a následného laboratórneho spracovania biologického materiálu (izolácia DNA,/RNA, RT - PCR)
2. Zistiť výskyt a sezónnu dynamiku kliešťov Ixodes ricinus a kliešťami-prenášaných patogénov na vybranej modelovej lokalite na východnom Slovensku
3. Zistiť druhovú diverzitu a prevalenciu DNA (Borrelia spp., Babesia spp., Anaplasma spp.) a RNA (vírus kliešťovej encefalitídy) patogénov v kliešťoch pomocou molekulovo-genetických metód na báze PCR
Seznam doporučené literatury
1. Sprong H, Azagi T, Hoornstra D, Nijhof AM, Knorr S, Baarsma ME, Hovius JW. Control of Lyme borreliosis and other Ixodes ricinus-borne diseases. Parasit Vectors. 2018 Mar 6;11(1):145.
2. Tomassone L, Berriatua E, De Sousa R, Duscher GG, Mihalca AD, Silaghi C, Sprong H, Zintl A. Neglected vector-borne zoonoses in Europe: Into the wild. Vet Parasitol. 2018 Feb 15;251:17-26.
3. Vonesch N, D'Ovidio MC, Melis P, Remoli ME, Ciufolini MG, Tomao P. Climate change, vector-borne diseases and working population. Ann Ist Super Sanita. 2016 Jul-Sep;52(3):397-405.
4. Růžek D. Tick-borne encefalitis - pathogenesis and -therapeutic approaches. Epidemiol Mikrobiol Imunol. 2015 Oct;64(4):204-9. Review. Czech.
Seznam doporučené literatury
1. Sprong H, Azagi T, Hoornstra D, Nijhof AM, Knorr S, Baarsma ME, Hovius JW. Control of Lyme borreliosis and other Ixodes ricinus-borne diseases. Parasit Vectors. 2018 Mar 6;11(1):145.
2. Tomassone L, Berriatua E, De Sousa R, Duscher GG, Mihalca AD, Silaghi C, Sprong H, Zintl A. Neglected vector-borne zoonoses in Europe: Into the wild. Vet Parasitol. 2018 Feb 15;251:17-26.
3. Vonesch N, D'Ovidio MC, Melis P, Remoli ME, Ciufolini MG, Tomao P. Climate change, vector-borne diseases and working population. Ann Ist Super Sanita. 2016 Jul-Sep;52(3):397-405.
4. Růžek D. Tick-borne encefalitis - pathogenesis and -therapeutic approaches. Epidemiol Mikrobiol Imunol. 2015 Oct;64(4):204-9. Review. Czech.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajobu bakalářské práce studentky Júlie Hurníkové zahájil prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. et Ph.D. Studentka seznámila komisi s hlavními částmi a výsledky své práce. Následovalo přečtení posudku vedoucího práce RNDr. Martina Kašného, Ph.D. a oponentky RNDr. Márie Novákové, Ph.D.
Studentka pak reagovala na připomínky a dotazy.
Prezentace studentky obsahovala tato témata:
- Ixodes ricinus - systematické zařazení, charakteristika, ontogeneze
- Babesia ssp. - charakteristika, choroby
- Borrelia burgdorferi s. l. - charakteristika, borelióza
- Anaplasma phagocytophilum - charakteristika, chorobné působení
- Virus klíšťové encefalitidy - charakteristika, chorobné působení
- Experimentální provedení práce
V rozpravě byly uvedeny následující připomínky či nastoleny tyto problémy:
- Sezónní aktivita klíšťat podle jiných autorů na Slovensku a v Evropě
- Výskyt klíšťat mezi říjnem a březnem na Slovensku
- Způsoby ochrany před klíšťaty
- Reprodukce klíšťat
Studentka na dotazy položené oponentkou práce a členy komise reagovala pohotově, věcně a přiměřeně.
Vzhledem k nepřítomnosti oponentky při obhajobě, studentka vypracovala odpovědi písemně předem.
Vedoucím práce bylo poskytnuto písemné vyjádření oponentky,
kde se pozitivně vyjadřuje k odpovědím studentky na položené otázky.