Tato bakalářská práce se zabývá studiem interakce mezi komplexem ruthenia s akridinovým ligandem a molekulou DNA. Mezi aplikované biofyzikální metody patří měření teploty tání, cirkulární dichroismus, viskozimetrie, elektroforéza v nativním agarózovém gelu, atomová absorpční spektrometrie a elektronová absorpční a fluorescenční spektroskopie. Výstupy objasňují mechanismus interakce studovaného komplexu Ru1 s DNA. Získané výsledky jsou diskutovány s ohledem na protinádorovou účinnost této látky. Výsledky studie prokázaly interkalační vazbu rutheniového komplexu k molekule DNA.
Anotace v angličtině
The aim of this bachelor thesis is to study interactions between a ruthenium complex bearing acridine ligand and a molecule of DNA. Applied biophysical methods are measurement of the melting point, circular dichroism, viscometry, electrophoresis in native agarose gels, atomic absorption spectrometry, electronic absorption spectroscopy, and fluorescence spectroscopy. Outcomes clarify a mechanism of the interaction of the investigated complex Ru1 with DNA. Obtained results are discussed with respect to the effectiveness of this substance against tumours. The result of this study indicated intercalation of ruthenium complex into the molecule of DNA.
Klíčová slova
DNA, interkalace, vazba do žlábku, komplex ruthenia
Klíčová slova v angličtině
DNA, intercalation, minor and major groove binding, ruthenium complex
Rozsah průvodní práce
49 s. (79 366 znaků)
Jazyk
CZ
Anotace
Tato bakalářská práce se zabývá studiem interakce mezi komplexem ruthenia s akridinovým ligandem a molekulou DNA. Mezi aplikované biofyzikální metody patří měření teploty tání, cirkulární dichroismus, viskozimetrie, elektroforéza v nativním agarózovém gelu, atomová absorpční spektrometrie a elektronová absorpční a fluorescenční spektroskopie. Výstupy objasňují mechanismus interakce studovaného komplexu Ru1 s DNA. Získané výsledky jsou diskutovány s ohledem na protinádorovou účinnost této látky. Výsledky studie prokázaly interkalační vazbu rutheniového komplexu k molekule DNA.
Anotace v angličtině
The aim of this bachelor thesis is to study interactions between a ruthenium complex bearing acridine ligand and a molecule of DNA. Applied biophysical methods are measurement of the melting point, circular dichroism, viscometry, electrophoresis in native agarose gels, atomic absorption spectrometry, electronic absorption spectroscopy, and fluorescence spectroscopy. Outcomes clarify a mechanism of the interaction of the investigated complex Ru1 with DNA. Obtained results are discussed with respect to the effectiveness of this substance against tumours. The result of this study indicated intercalation of ruthenium complex into the molecule of DNA.
Klíčová slova
DNA, interkalace, vazba do žlábku, komplex ruthenia
Klíčová slova v angličtině
DNA, intercalation, minor and major groove binding, ruthenium complex
Zásady pro vypracování
1) Vypracovat přehled problematiky na téma struktura a vlastnosti DNA a její interakce s nízkomolekulárními látkami. Zaměřit se na dosud známé informace o interakci DNA s protinádorově účinnými komplexy těžkých kovů, především ruthenia.
2) Provést experimenty zaměřené na stanovení vazby a některých vazebných charakteristik nového komplexu ruthenia s akridinovým ligandem.
3) Diskutovat naměřené výsledky a na jejich základě odvodit, jakým mechanismem se nová sloučenina na DNA váže.
Zásady pro vypracování
1) Vypracovat přehled problematiky na téma struktura a vlastnosti DNA a její interakce s nízkomolekulárními látkami. Zaměřit se na dosud známé informace o interakci DNA s protinádorově účinnými komplexy těžkých kovů, především ruthenia.
2) Provést experimenty zaměřené na stanovení vazby a některých vazebných charakteristik nového komplexu ruthenia s akridinovým ligandem.
3) Diskutovat naměřené výsledky a na jejich základě odvodit, jakým mechanismem se nová sloučenina na DNA váže.
Seznam doporučené literatury
1. Suh, D. and Chaires, J. B. (1995) Criteria for the Mode of Binding of DNA Binding Agents. Bioorganic & Medicinal Chemistry, Vol. 3, No. 6, pp. 723-728,
2. Alessio, E., Mestroni, G., Bergamo, A., and Sava, G. (2004) Ruthenium antimetastatic agents, Curr. Topics Med. Chem. 4, 1525-1535.
3. Ang, W. H., and Dyson, P. J. (2006) Classical and non-classical ruthenium-based anticancer drugs: Towards targeted chemotherapy, Eur. J. Inorg. Chem., 4003-4018.
4. Foxon, S. P., Green, C., Walker, M. G., Wragg, A., Adams, H., Weinstein, J. A., Parker, S. C., Meijer, A. J. H. M., and Thomas, J. A. (2011) Synthesis, Characterization, and DNA Binding Properties of Ruthenium(II) Complexes Containing the Redox Active Ligand Benzo[i]dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine-11,16-quinone, Inorg. Chem. 51, 463-471.
5. Sun, Y., Li, J., Zhao, H., and Tan, L. (2016) Ruthenium(II) polypyridyl complexes with 1,8-naphthalimide group as DNA binder, photonuclease, and dual inhibitors of topoisomerases I and II, J. Inorg. Biochem. 163, 88-94.
6. Janockova, J., Zilecka, E., Kasparkova, J., Brabec, V., Soukup, O., Kuca, K., and Kozurkova, M. (2016) Assessment of DNA-binding affinity of cholinesterase reactivators and electrophoretic determination of their effect on topoisomerase I and II activity, Mol. BioSyst. 12, 2910-2920.
7. Plsikova, J., Stepankova, J., Kasparkova, J., Brabec, V., Backor, M., and Kozurkova, M. (2014) Lichen secondary metabolites as DNA-interacting agents, Toxicology in Vitro 28, 182-186.
a další literatura podle doporučení vedoucího práce
Seznam doporučené literatury
1. Suh, D. and Chaires, J. B. (1995) Criteria for the Mode of Binding of DNA Binding Agents. Bioorganic & Medicinal Chemistry, Vol. 3, No. 6, pp. 723-728,
2. Alessio, E., Mestroni, G., Bergamo, A., and Sava, G. (2004) Ruthenium antimetastatic agents, Curr. Topics Med. Chem. 4, 1525-1535.
3. Ang, W. H., and Dyson, P. J. (2006) Classical and non-classical ruthenium-based anticancer drugs: Towards targeted chemotherapy, Eur. J. Inorg. Chem., 4003-4018.
4. Foxon, S. P., Green, C., Walker, M. G., Wragg, A., Adams, H., Weinstein, J. A., Parker, S. C., Meijer, A. J. H. M., and Thomas, J. A. (2011) Synthesis, Characterization, and DNA Binding Properties of Ruthenium(II) Complexes Containing the Redox Active Ligand Benzo[i]dipyrido[3,2-a:2',3'-c]phenazine-11,16-quinone, Inorg. Chem. 51, 463-471.
5. Sun, Y., Li, J., Zhao, H., and Tan, L. (2016) Ruthenium(II) polypyridyl complexes with 1,8-naphthalimide group as DNA binder, photonuclease, and dual inhibitors of topoisomerases I and II, J. Inorg. Biochem. 163, 88-94.
6. Janockova, J., Zilecka, E., Kasparkova, J., Brabec, V., Soukup, O., Kuca, K., and Kozurkova, M. (2016) Assessment of DNA-binding affinity of cholinesterase reactivators and electrophoretic determination of their effect on topoisomerase I and II activity, Mol. BioSyst. 12, 2910-2920.
7. Plsikova, J., Stepankova, J., Kasparkova, J., Brabec, V., Backor, M., and Kozurkova, M. (2014) Lichen secondary metabolites as DNA-interacting agents, Toxicology in Vitro 28, 182-186.
a další literatura podle doporučení vedoucího práce
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Studentka v úvodu seznámila přítomné s výsledky své bakalářské práce. Poté byly přečteny posudky školitele a oponenta. Studentka reagovala na jejich dotazy a připomínky. Poté studentka zodpověděla dotazy členů komise a hostů.