Pšenice setá (Triticum aestivum L.) je jednou ze zemědělsky nejdůležitějších plodin. V současnosti je zdrojem přibližně 20 % kalorií přijímaných lidmi po celém světě. Zvyšování její produkce je podstatné pro zajištění dostatku potravy a společenské stability. Zelená revoluce v 60. letech minulého století znamenala výrazný nárůst v produkci pšenice s využitím úspěšných šlechtitelských programů, avšak produkce by se vzhledem k nárůstu počtu lidí měla do roku 2050 zdvojnásobit. Zvýšení výnosového potenciálu je klíčové k dosažení tohoto cíle.
Studium pšenice je komplikováno jejím velkým hexaploidním genomem. Proto se jako model genomu A často používá diploidní pšenice jednozrnka (T. monococcum L.), která může také posloužit jako zdroj genů ke zlepšení vlastností pšenice seté.
Předkládaná bakalářská práce se skládá z teoretické a praktické části. Teoretická část je zaměřena na metody zkoumání pšenice. Cílem praktické části bylo genotypování verifikačních mapovacích populací F2 T. monococcum L. a verifikace lokusů kvantitativních znaků mapovaných na F8-12 mapovací populaci vzniklé křížením T. monococcum L. DV92 a T. boeoticum Boiss. G3116.
Jednomarkerovou regresí a jednofaktorovou analýzou rozptylu bylo detekováno 30 lokusů kvantitativních znaků. 13 z těchto lokusů bylo verifikováno, a to 5 lokusů pro rozkladitost trsu na chromozómech 2Am a 5Am, 3 lokusy pro chlupatost listů na 3Am a 5Am, 2 lokusy pro dobu kvetení na 1Am, 1 lokus pro výšku rostliny na 2Am, 1 lokus pro délku klasu na 4Am a 1 lokus pro hustotu klasu na 4Am.
Anotace v angličtině
Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important agronomic crops. It is a source of approximately 20 % of calories consumed by humans all around the world. Production growth is essential to ensuring food supply and social stability. The Green Revolution in the 1960s meant a significant increase in grain production driven by successful breeding management. However, the production should be doubled by 2050 to meet the demands from the rising human population. Improvement in the yield potential is crucial to fulfil this challenge.
Wheat's large hexaploid genome complicates the research; therefore, diploid Einkorn wheat (T. monococcum L.) is often applied as a model of genome A and also can be used as a source of genes to enrich the gene pool of common wheat.
This Bachelor's thesis consists of a theoretical and a practical part. The theoretical part is focused on methods of wheat research. The aim of the practical part was to genotype the F2 verification mapping populations of T. monococcum L. and to verify quantitative trait loci mapped on the F8-12 mapping population generated from a cross between T. monococcum L. DV92 and T. boeoticum Boiss. G3116.
30 quantitative trait loci were detected by single-marker regression and one-factor analysis of variance. 13 of them were verified: 5 loci for tuft shape on chromosomes 2Am and 5Am, 3 loci for leaf hairiness on 3Am and 5Am, 2 loci for flowering time on 1Am, 1 loci for plant height on 2Am, 1 loci for spike length on 4Am and 1 loci for spike density on 4Am.
Klíčová slova
pšenice, Triticum monococcum, Triticum aestivum, verifikace QTL, hustota klasu, délka klasu, výška rostliny, doba kvetení, rozkladitost trsu, chlupatost listů
Klíčová slova v angličtině
wheat, Triticum monococcum, Triticum aestivum, verification of QTL, spike density, spike length, plant height, flowering time, tuft shape, leaf hairiness
Rozsah průvodní práce
55
Jazyk
CZ
Anotace
Pšenice setá (Triticum aestivum L.) je jednou ze zemědělsky nejdůležitějších plodin. V současnosti je zdrojem přibližně 20 % kalorií přijímaných lidmi po celém světě. Zvyšování její produkce je podstatné pro zajištění dostatku potravy a společenské stability. Zelená revoluce v 60. letech minulého století znamenala výrazný nárůst v produkci pšenice s využitím úspěšných šlechtitelských programů, avšak produkce by se vzhledem k nárůstu počtu lidí měla do roku 2050 zdvojnásobit. Zvýšení výnosového potenciálu je klíčové k dosažení tohoto cíle.
Studium pšenice je komplikováno jejím velkým hexaploidním genomem. Proto se jako model genomu A často používá diploidní pšenice jednozrnka (T. monococcum L.), která může také posloužit jako zdroj genů ke zlepšení vlastností pšenice seté.
Předkládaná bakalářská práce se skládá z teoretické a praktické části. Teoretická část je zaměřena na metody zkoumání pšenice. Cílem praktické části bylo genotypování verifikačních mapovacích populací F2 T. monococcum L. a verifikace lokusů kvantitativních znaků mapovaných na F8-12 mapovací populaci vzniklé křížením T. monococcum L. DV92 a T. boeoticum Boiss. G3116.
Jednomarkerovou regresí a jednofaktorovou analýzou rozptylu bylo detekováno 30 lokusů kvantitativních znaků. 13 z těchto lokusů bylo verifikováno, a to 5 lokusů pro rozkladitost trsu na chromozómech 2Am a 5Am, 3 lokusy pro chlupatost listů na 3Am a 5Am, 2 lokusy pro dobu kvetení na 1Am, 1 lokus pro výšku rostliny na 2Am, 1 lokus pro délku klasu na 4Am a 1 lokus pro hustotu klasu na 4Am.
Anotace v angličtině
Common wheat (Triticum aestivum L.) is one of the most important agronomic crops. It is a source of approximately 20 % of calories consumed by humans all around the world. Production growth is essential to ensuring food supply and social stability. The Green Revolution in the 1960s meant a significant increase in grain production driven by successful breeding management. However, the production should be doubled by 2050 to meet the demands from the rising human population. Improvement in the yield potential is crucial to fulfil this challenge.
Wheat's large hexaploid genome complicates the research; therefore, diploid Einkorn wheat (T. monococcum L.) is often applied as a model of genome A and also can be used as a source of genes to enrich the gene pool of common wheat.
This Bachelor's thesis consists of a theoretical and a practical part. The theoretical part is focused on methods of wheat research. The aim of the practical part was to genotype the F2 verification mapping populations of T. monococcum L. and to verify quantitative trait loci mapped on the F8-12 mapping population generated from a cross between T. monococcum L. DV92 and T. boeoticum Boiss. G3116.
30 quantitative trait loci were detected by single-marker regression and one-factor analysis of variance. 13 of them were verified: 5 loci for tuft shape on chromosomes 2Am and 5Am, 3 loci for leaf hairiness on 3Am and 5Am, 2 loci for flowering time on 1Am, 1 loci for plant height on 2Am, 1 loci for spike length on 4Am and 1 loci for spike density on 4Am.
Klíčová slova
pšenice, Triticum monococcum, Triticum aestivum, verifikace QTL, hustota klasu, délka klasu, výška rostliny, doba kvetení, rozkladitost trsu, chlupatost listů
Klíčová slova v angličtině
wheat, Triticum monococcum, Triticum aestivum, verification of QTL, spike density, spike length, plant height, flowering time, tuft shape, leaf hairiness
Zásady pro vypracování
1) Zpracování literární rešerše na téma bakalářské práce:
- Pšenice setá jako objekt zkoumání. Důležité agronomické znaky.
- Genetické mapování u pšenice - příprava mapovacích populací, nejčastěji používané DNA markery, principy genetického mapování.
2) Rozšíření genetické mapovací populace a design nových markerů.
3) Saturace lokusů markery.
4) Zpracování, vyhodnocení a diskuze získaných výsledků.
Zásady pro vypracování
1) Zpracování literární rešerše na téma bakalářské práce:
- Pšenice setá jako objekt zkoumání. Důležité agronomické znaky.
- Genetické mapování u pšenice - příprava mapovacích populací, nejčastěji používané DNA markery, principy genetického mapování.
2) Rozšíření genetické mapovací populace a design nových markerů.
3) Saturace lokusů markery.
4) Zpracování, vyhodnocení a diskuze získaných výsledků.
Seznam doporučené literatury
Jakobson, I., Peusha, H., Timofejeva, L., Järve, K. (2006): Adult plant and seedling resistance to powdery mildew in a Triticum aestivum x Triticum militinae hybrid line. Theoretical and Applied Genetics 112: 760 - 769
Devos, K.M., Doležel, J., Feuillet, C. (2009): Genome organization and comparative genomics. In: Carver, B.F. (ed.): Wheat - Science and Trade, pp. 327 - 367, Wiley-Blackwell, Iowa
Yahiaoui, N., Srichumpa, P., Dudler, R., Keller, B. (2004): Genome analysis at different ploidy levels allows cloning of the powdery mildew resistance gene Pm3b from hexaploid wheat. Plant Journal 37: 528 - 538
Riera-Lizarazu, O., Leonard, J. M., Tiwari, V. K., Kianian, S. F. (2010): A Method to Produce Radiation Hybrids for the D-Genome Chromosomes of Wheat (Triticum aestivum L.). Cytogenetic and Genome Research 129: 234 - 240
Seznam doporučené literatury
Jakobson, I., Peusha, H., Timofejeva, L., Järve, K. (2006): Adult plant and seedling resistance to powdery mildew in a Triticum aestivum x Triticum militinae hybrid line. Theoretical and Applied Genetics 112: 760 - 769
Devos, K.M., Doležel, J., Feuillet, C. (2009): Genome organization and comparative genomics. In: Carver, B.F. (ed.): Wheat - Science and Trade, pp. 327 - 367, Wiley-Blackwell, Iowa
Yahiaoui, N., Srichumpa, P., Dudler, R., Keller, B. (2004): Genome analysis at different ploidy levels allows cloning of the powdery mildew resistance gene Pm3b from hexaploid wheat. Plant Journal 37: 528 - 538
Riera-Lizarazu, O., Leonard, J. M., Tiwari, V. K., Kianian, S. F. (2010): A Method to Produce Radiation Hybrids for the D-Genome Chromosomes of Wheat (Triticum aestivum L.). Cytogenetic and Genome Research 129: 234 - 240
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajobu bakalářské práce studenta Adama Lampara zahájil prof. RNDr. Milan Navrátil, CSc. Student seznámil komisi s hlavními částmi a výsledky své práce. Následovalo přečtení posudku vedoucího práce Mgr. Miroslava Valárika, Ph.D. a oponenta RNDr. Jana Šafáře, Ph.D.
Student pak reagoval na připomínky a dotazy.
Prezentace studenta obsahovala tato témata:
- Pšenice - charakteristika, původ, využití
- QTL znaky, detekce jejich lokusů
- Experimentální ´background´ experimentu, příprava mapovací populace
- Optimalizace metody, genotypování - detekce polymorfismu.
- Analýza a verifikace 13 vytipovaných QTL na CH1,2,3 pro vybrané znaky
V rozpravě byly uvedeny následující připomínky či nastoleny tyto problémy:
- Vysoká kvalita předložené práce, přesahující běžné standardy bakalářské práce.
- Důvody verifikace znaků jen na jedné mapovací populaci, genetické faktory na odlišné penentranci vybraných znaků.
- Úspěšný přenos vhodné alely do elitního kultivaru kulturní plodiny - příklad přenos genů rezistence vůči rzi travní do cv. Hope a H44-24.
- Příčiny nízké využitelnosti zájmových genů a jejich přenosu do elitních plodin - efekt ´linkage drive´.
- Geneticky modifikované plodiny - moderní metody přenosu genů
- Pšenice - výnosové parametry plodiny, limitace výnosových parametrů
Student na dotazy položené oponentem práce a členy komise reagoval pohotově, věcně, s širokou znalostí problematiky.