MikroRNA jsou krátké nekódující RNA, které ovlivňují širokou škálu buněčných aktivit. Ovlivněním exprese určitých cílových proteinů pak mohou mikroRNA zvyšovat citlivost nádorů vůči chemoterapii. Cílem studenta bude posoudit možnost alternativního splicingu indukovaného vybranými mikroRNA a možného mechanismu zvyšování citlivosti buněk na chemoterapii vlivem transportu vybraných mikroRNA do jádra. Zásadními metodami pro experimentální práci budou real-time PCR, fluorescenční detekce a imunodetekce.
Anotace v angličtině
MiRNA is a short, non-coding RNA that could influence a wide variety of cellular processes. By affecting the expression of Mcl-1 protein miRNA may increase the sensitivity of a tumor towards chemotherapies. Aim of this work was to evaluate alternative splicing induced by selected miRNAs and possible increase in cell sensitivity towards chemotherapy due to nuclear transport of miRNA 101 and its mutants. MEthods of fluorecent detection, immunodetection and RT-PCR were used for experiments.
Klíčová slova
miRNA 101, apoptóza, MCL-1
Klíčová slova v angličtině
miRNA 101, apoptosis, MCL-1
Rozsah průvodní práce
55 s. (61 317 znaků)
Jazyk
CZ
Anotace
MikroRNA jsou krátké nekódující RNA, které ovlivňují širokou škálu buněčných aktivit. Ovlivněním exprese určitých cílových proteinů pak mohou mikroRNA zvyšovat citlivost nádorů vůči chemoterapii. Cílem studenta bude posoudit možnost alternativního splicingu indukovaného vybranými mikroRNA a možného mechanismu zvyšování citlivosti buněk na chemoterapii vlivem transportu vybraných mikroRNA do jádra. Zásadními metodami pro experimentální práci budou real-time PCR, fluorescenční detekce a imunodetekce.
Anotace v angličtině
MiRNA is a short, non-coding RNA that could influence a wide variety of cellular processes. By affecting the expression of Mcl-1 protein miRNA may increase the sensitivity of a tumor towards chemotherapies. Aim of this work was to evaluate alternative splicing induced by selected miRNAs and possible increase in cell sensitivity towards chemotherapy due to nuclear transport of miRNA 101 and its mutants. MEthods of fluorecent detection, immunodetection and RT-PCR were used for experiments.
Klíčová slova
miRNA 101, apoptóza, MCL-1
Klíčová slova v angličtině
miRNA 101, apoptosis, MCL-1
Zásady pro vypracování
MikroRNA jsou krátké nekódující RNA, které ovlivňují širokou škálu buněčných aktivit. Ovlivněním exprese určitých cílových proteinů pak mohou mikroRNA zvyšovat citlivost nádorů vůči chemoterapii. Cílem studenta bude posoudit možnost alternativního splicingu indukovaného vybranými mikroRNA a možného mechanismu zvyšování citlivosti buněk na chemoterapii vlivem transportu vybraných mikroRNA do jádra. Zásadními metodami pro experimentální práci budou real-time PCR, fluorescenční detekce a imunodetekce.
Zásady pro vypracování
MikroRNA jsou krátké nekódující RNA, které ovlivňují širokou škálu buněčných aktivit. Ovlivněním exprese určitých cílových proteinů pak mohou mikroRNA zvyšovat citlivost nádorů vůči chemoterapii. Cílem studenta bude posoudit možnost alternativního splicingu indukovaného vybranými mikroRNA a možného mechanismu zvyšování citlivosti buněk na chemoterapii vlivem transportu vybraných mikroRNA do jádra. Zásadními metodami pro experimentální práci budou real-time PCR, fluorescenční detekce a imunodetekce.
Seznam doporučené literatury
Donald Voet, Judith G. Voet. Biochemie. Praha: Victoria Publishing, 1995. ISBN 8085605449.
S. Kollinerová, Z. Dostál, M. Modrianský, MicroRNA hsa-miR-29b potentiates etoposide toxicity in HeLa cells via down-regulation of Mcl-1, Toxicology in vitro 40, 289-296, 2017
Seznam doporučené literatury
Donald Voet, Judith G. Voet. Biochemie. Praha: Victoria Publishing, 1995. ISBN 8085605449.
S. Kollinerová, Z. Dostál, M. Modrianský, MicroRNA hsa-miR-29b potentiates etoposide toxicity in HeLa cells via down-regulation of Mcl-1, Toxicology in vitro 40, 289-296, 2017
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodní části obhajoby studentka Tereza Virglová seznámila komisi s hlavními částmi a výsledky své závěrečné práce: "Biologická aktivita miRNA"
Následovalo přečtení posudku vedoucího práce prof. Modrianského a poté oponentky Dr. Smešný Trtkové.
V průběhu obhajoby studentka reagovala na následující připomínky a dotazy oponenta:
1. Zajímal by mne postup po imunodetekci, kterým jste dospěla k procentickému vyhodnocení poměru dlouhé a krátké formy proteinu Mcl-1 (Tab. 8) nebo u laminu a ?-tubulinu (Tab. 10).
2. Jaký typ vyhodnocení expresní analýzy sledovaných miRNAs jste použila - absolutní nebo relativní kvantifikaci nebo jiný postup?
3. Nerozumím grafům na Obr. 18 a Obr. 19. Mohla byste prosím popsat zdrojová data a postup jak jste k těmto grafům dospěla?
Další dotazy z řad členů komise a auditoria:
prof. Hlaváč - sepisování exp. části třetí osoba jednotného čísla. Topoisomerása-poškozuje DNA? Co má za funkci? Slide 12 - grafy, velké směrodatné odchylky, relevantní hodnocení dat.
doc. Soural - slide 15 - metoda stanovení poměru cytosolu v jádře.
Oponent - opakování experimentů.
Mgr. Kriegelstein - poměr RNA v jádře a cytosolu.
Všechny dotazy položené oponentem i členy komise studentka uspokojivě zodpověděla.
Práce byla hodnocena známkou: B