Mykorhiza je symbiotické soužití hub s kořeny vyšších rostlin. Při tomto procesu může docházet buď k pronikání houbových vláken do kořenových buněk primární kůry, nebo houbová vlákna zůstávají pouze v mezibuněčném prostoru. Mykorhizní kolonizace rostlin může přinést značné výhody v podobě zlepšení růstu, příjmu živin a v některých případech i výnosu. Endofytické houby žijí uvnitř rostlinného těla a jsou spojeny přímo s jejich pletivy. Tyto houby se vyskytují jak v podzemních částech částech rostliny, tak i v částech nadzemních. Mohou být prospěšné, především jako ochrana vůči herbivorům a patogenům.
Teoretická část této práce se zaměřuje na popis mykorhizních a endofytických hub a jejich význam. Dále je zde uvedena charakteristika organismů Microdochium bolleyi, Serendipita indica a Brachypodium distachyon.
Cílem praktické části bylo založit skleníkové experimenty s modelovou rostlinou Brachypodium distachyon, studovat kolonizaci hostitelské rostliny a posoudit vliv endofytů na růstové a vývojové charakteristiky rostlin pomocí vizuálního hodnocení, vážení biomasy a využití mikroskopických a molekulárních technik, včetně qPCR. Byl zjištěn vliv použitých endofytů na růst a vývoj rostlin. Endofyty byly úspěšně detekovány pomocí kvantitativní Real-Time PCR a bylo také stanoveno relativní množství endofytu v kořenech rostlin B. distachyon. Přítomnost endofytů byla v jednotlivých kořenech pozorována i pomocí mikroskopu.
Anotace v angličtině
Mycorrhiza is the symbiotic coexistence of fungi with the roots of higher plants. In this process, either fungal filaments penetrate the root cells of the primary cortex or fungal filaments remain only in the intercellular space. Mycorrhizal colonisation of plants can provide significant benefits in terms of improved growth, nutrient uptake and, in some cases, yield. Endophytic fungi live inside the plant body and are associated directly with its tissues. These fungi are found both in the underground parts of the plant and in the above-ground parts. They can be beneficial, especially as protection against herbicides and pathogens.
The theoretical part of this thesis focuses on the description of mycorrhizal and endophytic fungi and their importance. Furthermore, the characteristics of Microdochium bolleyi, Serendipita indica and Brachypodium distachyon are presented.
The aim of the practical part was to set up greenhouse experiments with the model plant Brachypodium distachyon, to study the colonization of the host plant and to assess the effect of endophytes on plant growth and developmental characteristics by visual assessment, biomass weighing and the use of microscopic and molecular techniques, including qPCR. The effect of the endophytes used on plant growth and development was determined. Endophytes were successfully detected by quantitative Real-Time PCR and the relative amount of endophyte in the roots of B. distachyon plants was also determined. The presence of endophytes was also observed in individual roots using a microscope.
Mykorhiza je symbiotické soužití hub s kořeny vyšších rostlin. Při tomto procesu může docházet buď k pronikání houbových vláken do kořenových buněk primární kůry, nebo houbová vlákna zůstávají pouze v mezibuněčném prostoru. Mykorhizní kolonizace rostlin může přinést značné výhody v podobě zlepšení růstu, příjmu živin a v některých případech i výnosu. Endofytické houby žijí uvnitř rostlinného těla a jsou spojeny přímo s jejich pletivy. Tyto houby se vyskytují jak v podzemních částech částech rostliny, tak i v částech nadzemních. Mohou být prospěšné, především jako ochrana vůči herbivorům a patogenům.
Teoretická část této práce se zaměřuje na popis mykorhizních a endofytických hub a jejich význam. Dále je zde uvedena charakteristika organismů Microdochium bolleyi, Serendipita indica a Brachypodium distachyon.
Cílem praktické části bylo založit skleníkové experimenty s modelovou rostlinou Brachypodium distachyon, studovat kolonizaci hostitelské rostliny a posoudit vliv endofytů na růstové a vývojové charakteristiky rostlin pomocí vizuálního hodnocení, vážení biomasy a využití mikroskopických a molekulárních technik, včetně qPCR. Byl zjištěn vliv použitých endofytů na růst a vývoj rostlin. Endofyty byly úspěšně detekovány pomocí kvantitativní Real-Time PCR a bylo také stanoveno relativní množství endofytu v kořenech rostlin B. distachyon. Přítomnost endofytů byla v jednotlivých kořenech pozorována i pomocí mikroskopu.
Anotace v angličtině
Mycorrhiza is the symbiotic coexistence of fungi with the roots of higher plants. In this process, either fungal filaments penetrate the root cells of the primary cortex or fungal filaments remain only in the intercellular space. Mycorrhizal colonisation of plants can provide significant benefits in terms of improved growth, nutrient uptake and, in some cases, yield. Endophytic fungi live inside the plant body and are associated directly with its tissues. These fungi are found both in the underground parts of the plant and in the above-ground parts. They can be beneficial, especially as protection against herbicides and pathogens.
The theoretical part of this thesis focuses on the description of mycorrhizal and endophytic fungi and their importance. Furthermore, the characteristics of Microdochium bolleyi, Serendipita indica and Brachypodium distachyon are presented.
The aim of the practical part was to set up greenhouse experiments with the model plant Brachypodium distachyon, to study the colonization of the host plant and to assess the effect of endophytes on plant growth and developmental characteristics by visual assessment, biomass weighing and the use of microscopic and molecular techniques, including qPCR. The effect of the endophytes used on plant growth and development was determined. Endophytes were successfully detected by quantitative Real-Time PCR and the relative amount of endophyte in the roots of B. distachyon plants was also determined. The presence of endophytes was also observed in individual roots using a microscope.
2. Charakterizace mykorhizních a endofytických hub
3. Popis současných znalostí o mykorhizních a endofytických houbách ve vztahu k rostlinám
4. Založení a vedení experimentů ve skleníku, popř. fytotronu (kultivace hub, příprava hostitele)
5. Hodnocení vlivu endofytických hub na rostliny (pravidelné sledování a zaznamenávání růstových fází)
6. Mikroskopování kořenů, zjišťování počtu semen, měření celkové sušiny
7. Vyhodnocení a zpracování dat.
Zásady pro vypracování
1. Zpracování literární rešerše k danému tématu.
2. Charakterizace mykorhizních a endofytických hub
3. Popis současných znalostí o mykorhizních a endofytických houbách ve vztahu k rostlinám
4. Založení a vedení experimentů ve skleníku, popř. fytotronu (kultivace hub, příprava hostitele)
5. Hodnocení vlivu endofytických hub na rostliny (pravidelné sledování a zaznamenávání růstových fází)
6. Mikroskopování kořenů, zjišťování počtu semen, měření celkové sušiny
7. Vyhodnocení a zpracování dat.
Seznam doporučené literatury
Nuria Ferrol, Luisa Lanfranco. 2020 Arbuscular Mycorrhizal Fungi, kniha
Fadiji AE and Babalola OO (2020) Elucidating Mechanisms of Endophytes Used in Plant Protection
and Other Bioactivities With Multifunctional Prospects. Front. Bioeng. Biotechnol. 8:467. doi: 10.3389/fbioe.2020.00467
Maheshswhary, A. Endophytes: Biology and Biotechnology, kniha
Fontana DC, de Paula S, Torres AG, de Souza VHM, Pascholati SF, Schmidt D, Dourado Neto D. Endophytic Fungi: Biological Control and Induced Resistance to Phytopathogens and Abiotic Stresses. Pathogens. 2021 May 8;10(5):570. doi: 10.3390/pathogens10050570. PMID: 34066672; PMCID: PMC8151296.
Colin Averill Jennifer M. Bhatnagar, Michael C. Dietze and Stephanie N. Edited by Sarah E. Hobbie, Global imprint of mycorrhizal fungi on whole-plant nutrient economics.2019, 116 (46) 23163-23168 https://doi.org/10.1073/pnas.1906655116
Seznam doporučené literatury
Nuria Ferrol, Luisa Lanfranco. 2020 Arbuscular Mycorrhizal Fungi, kniha
Fadiji AE and Babalola OO (2020) Elucidating Mechanisms of Endophytes Used in Plant Protection
and Other Bioactivities With Multifunctional Prospects. Front. Bioeng. Biotechnol. 8:467. doi: 10.3389/fbioe.2020.00467
Maheshswhary, A. Endophytes: Biology and Biotechnology, kniha
Fontana DC, de Paula S, Torres AG, de Souza VHM, Pascholati SF, Schmidt D, Dourado Neto D. Endophytic Fungi: Biological Control and Induced Resistance to Phytopathogens and Abiotic Stresses. Pathogens. 2021 May 8;10(5):570. doi: 10.3390/pathogens10050570. PMID: 34066672; PMCID: PMC8151296.
Colin Averill Jennifer M. Bhatnagar, Michael C. Dietze and Stephanie N. Edited by Sarah E. Hobbie, Global imprint of mycorrhizal fungi on whole-plant nutrient economics.2019, 116 (46) 23163-23168 https://doi.org/10.1073/pnas.1906655116