Bakalářská práce se zabývá prostorovým vzorem vybraných infekčních nemocí v Česku. Nejprve je provedena vizuální analýza a identifikace hlavních oblastí incidence. Výskyt nemocí je vizualizován v administrativních jednotkách nebo v pravidelných hexagonálních sítích. Poté je provedena prostorová analýza včetně analýz shlukování. Výsledky jsou interpretovány a srovnány mezi sebou. Na závěr jsou analýzy vloženy do socio-ekonomického kontextu a je provedena typizace administrativních jednotek podle výskytu nemocí a socio-ekonomických faktorů. V práci jsou využívány metody pro prostorovou analýzu a pro vizualizaci prostorových kvantitativních dat. Práce byla primárně vyhotovena za pomocí nástrojů ze sady Spatial Statistics v programu ArcGIS Pro. Hlavními výstupy práce je série map incidence, výsledků analýz a ucelená geodatabáze. Výsledky práce jsou hodnocení vzoru a použitelnost metod, hodnocení prostorového vzoru příslušných nemocí a geografické závěry o jejich výskytu včetně souvislosti s deprivací a příslušností k venkovu. Mezi konkrétní zjištění patří rozdílnost prostorových vzorů jednotlivých infekčních onemocnění, proměnlivost shlukování nemoci COVID-19 v čase nebo závislost výskytu infekčních nemocí a příslušností k venkovu.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis focuses on the spatial pattern of selected infectious diseases in the Czech Republic. At first, a visual analysis is done to identify the main areas of incidence. The disease occurrence is visualized in administrative units or grids of regular hexagons. Then a spatial analysis is done including cluster analysis. In the final part, the analyses are placed in a socio-economic context, and the administrative units are categorized according to disease occurrence and socio-economic factors. Various methods for spatial analysis and visualization of spatial quantitative data are used in this thesis. The work was primarly done using tools from the Spatial statistics toolbox in ArcGIS Pro. The main outputs of the thesis are a series of disease maps, analyses results, and a complex geodatabase. The results evaluate the usability of methods, the spatial pattern of diseases, and geographical conclusions about their occurrence, including a relationship with deprivation and rural belonging. Specific results include differences in spatial patterns of individual infectious diseases, variability of clustering of COVID-19 over time, and the dependence of infectious disease occurrence on rural belonging.
Bakalářská práce se zabývá prostorovým vzorem vybraných infekčních nemocí v Česku. Nejprve je provedena vizuální analýza a identifikace hlavních oblastí incidence. Výskyt nemocí je vizualizován v administrativních jednotkách nebo v pravidelných hexagonálních sítích. Poté je provedena prostorová analýza včetně analýz shlukování. Výsledky jsou interpretovány a srovnány mezi sebou. Na závěr jsou analýzy vloženy do socio-ekonomického kontextu a je provedena typizace administrativních jednotek podle výskytu nemocí a socio-ekonomických faktorů. V práci jsou využívány metody pro prostorovou analýzu a pro vizualizaci prostorových kvantitativních dat. Práce byla primárně vyhotovena za pomocí nástrojů ze sady Spatial Statistics v programu ArcGIS Pro. Hlavními výstupy práce je série map incidence, výsledků analýz a ucelená geodatabáze. Výsledky práce jsou hodnocení vzoru a použitelnost metod, hodnocení prostorového vzoru příslušných nemocí a geografické závěry o jejich výskytu včetně souvislosti s deprivací a příslušností k venkovu. Mezi konkrétní zjištění patří rozdílnost prostorových vzorů jednotlivých infekčních onemocnění, proměnlivost shlukování nemoci COVID-19 v čase nebo závislost výskytu infekčních nemocí a příslušností k venkovu.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis focuses on the spatial pattern of selected infectious diseases in the Czech Republic. At first, a visual analysis is done to identify the main areas of incidence. The disease occurrence is visualized in administrative units or grids of regular hexagons. Then a spatial analysis is done including cluster analysis. In the final part, the analyses are placed in a socio-economic context, and the administrative units are categorized according to disease occurrence and socio-economic factors. Various methods for spatial analysis and visualization of spatial quantitative data are used in this thesis. The work was primarly done using tools from the Spatial statistics toolbox in ArcGIS Pro. The main outputs of the thesis are a series of disease maps, analyses results, and a complex geodatabase. The results evaluate the usability of methods, the spatial pattern of diseases, and geographical conclusions about their occurrence, including a relationship with deprivation and rural belonging. Specific results include differences in spatial patterns of individual infectious diseases, variability of clustering of COVID-19 over time, and the dependence of infectious disease occurrence on rural belonging.
Cílem práce je zachytit a vyhodnotit prostorový vzor vybraných infekčních nemocí v Česku pomocí metod prostorové analýzy. Student bude pracovat s daty od ÚZIS, které se budou týkat výskytu infekčních nemocí (například salmonelóza, kampylobakterióza, lymská borelióza, klíšťová encefalitida, virová hepatitida, hantaviry, spalničky, černý kašel), kdy tato data v prvním kroku prostorově vyhodnotí s využitím kvantitativních metod obvyklých při studiu této problematiky. V druhém kroku vsadí analýzy do socio-ekonomického kontextu (například vzdělánostní a věková struktura obyvatel, zdravotní péče, ruralita/urbanita, deprivační charakteristiky aj.), aby následně výsledky vhodně vizualizoval. Z výsledků student vyvodí geografické i společenské závěry. Průběh práce bude student konzultovat s doc. Holým a dr. Markem. Celá práce (text, přílohy, výstupy, zdrojová a vytvořená data) se odevzdá v digitální podobě na paměťovém nosiči (CD, DVD, SD karta, flash disk). Text práce s vybranými přílohami bude odevzdán ve dvou svázaných výtiscích na sekretariát katedry. O diplomové práci student vytvoří webovou stránku v souladu s pravidly dostupnými na stránkách katedry. Práce bude zpracována podle zásad dle Voženílek (2002) a závazné šablony pro diplomové práce na KGI. Povinnou přílohou práce bude poster formátu A2.
Zásady pro vypracování
Cílem práce je zachytit a vyhodnotit prostorový vzor vybraných infekčních nemocí v Česku pomocí metod prostorové analýzy. Student bude pracovat s daty od ÚZIS, které se budou týkat výskytu infekčních nemocí (například salmonelóza, kampylobakterióza, lymská borelióza, klíšťová encefalitida, virová hepatitida, hantaviry, spalničky, černý kašel), kdy tato data v prvním kroku prostorově vyhodnotí s využitím kvantitativních metod obvyklých při studiu této problematiky. V druhém kroku vsadí analýzy do socio-ekonomického kontextu (například vzdělánostní a věková struktura obyvatel, zdravotní péče, ruralita/urbanita, deprivační charakteristiky aj.), aby následně výsledky vhodně vizualizoval. Z výsledků student vyvodí geografické i společenské závěry. Průběh práce bude student konzultovat s doc. Holým a dr. Markem. Celá práce (text, přílohy, výstupy, zdrojová a vytvořená data) se odevzdá v digitální podobě na paměťovém nosiči (CD, DVD, SD karta, flash disk). Text práce s vybranými přílohami bude odevzdán ve dvou svázaných výtiscích na sekretariát katedry. O diplomové práci student vytvoří webovou stránku v souladu s pravidly dostupnými na stránkách katedry. Práce bude zpracována podle zásad dle Voženílek (2002) a závazné šablony pro diplomové práce na KGI. Povinnou přílohou práce bude poster formátu A2.
Seznam doporučené literatury
- MAREK, Lukáš. Prostorové a vícerozměrné statistické analýzy epidemiologických dat. Olomouc, 2015. disertační práce (Ph.D.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta - Lawson, A. B. (2013). Statistical methods in spatial epidemiology. John Wiley & Sons. - Lawson, A. B. et al. (2016). Handbook of Spatial Epidemiology. Chapman and Hall/CRC - Bencko, V. (2003). Statistické metody v epidemiologii, svazek 1 a 2. Praha : Karolinum, 2003 - Pászto, V., Burian, J., & Macku, K. (2020). Covid-19 data sources: evaluation of map applications and analysis of behavior changes in europe’s population. Geografie, 125(2), 171-209. - Pászto, V., Burian, J., & Macků, K. (2021). Changing mobility lifestyle: A case study on the impact of COVID-19 using personal google locations data. International Journal of E-Planning Research (IJEPR), 10(2), 66-79. - Campbell, M., Marek, L., Wiki, J., Hobbs, M., Sabel, C. E., McCarthy, J., & Kingham, S. (2021). National movement patterns during the COVID-19 pandemic in New Zealand: the unexplored role of neighbourhood deprivation. J Epidemiol Community Health, 75(9), 903-905. - Marek, L., & Pászto, V. (2017). Spatio-temporal outbreaks of campylobacteriosis and the role of fresh-milk vending machines in the Czech Republic: A methodological study. Geospatial health, 12(2).
- a další geografická, geoinformatická, či jiná literatura a softwarová dokumentace potřebná pro provedení práce.
Seznam doporučené literatury
- MAREK, Lukáš. Prostorové a vícerozměrné statistické analýzy epidemiologických dat. Olomouc, 2015. disertační práce (Ph.D.). UNIVERZITA PALACKÉHO V OLOMOUCI. Přírodovědecká fakulta - Lawson, A. B. (2013). Statistical methods in spatial epidemiology. John Wiley & Sons. - Lawson, A. B. et al. (2016). Handbook of Spatial Epidemiology. Chapman and Hall/CRC - Bencko, V. (2003). Statistické metody v epidemiologii, svazek 1 a 2. Praha : Karolinum, 2003 - Pászto, V., Burian, J., & Macku, K. (2020). Covid-19 data sources: evaluation of map applications and analysis of behavior changes in europe’s population. Geografie, 125(2), 171-209. - Pászto, V., Burian, J., & Macků, K. (2021). Changing mobility lifestyle: A case study on the impact of COVID-19 using personal google locations data. International Journal of E-Planning Research (IJEPR), 10(2), 66-79. - Campbell, M., Marek, L., Wiki, J., Hobbs, M., Sabel, C. E., McCarthy, J., & Kingham, S. (2021). National movement patterns during the COVID-19 pandemic in New Zealand: the unexplored role of neighbourhood deprivation. J Epidemiol Community Health, 75(9), 903-905. - Marek, L., & Pászto, V. (2017). Spatio-temporal outbreaks of campylobacteriosis and the role of fresh-milk vending machines in the Czech Republic: A methodological study. Geospatial health, 12(2).
- a další geografická, geoinformatická, či jiná literatura a softwarová dokumentace potřebná pro provedení práce.
Přílohy volně vložené
1 poster
Přílohy vázané v práci
mapy
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodu obhajoby student seznámil komisi s cíli, metodami a výsledky své bakalářské práce. Následně přednesli své posudky vedoucí práce a oponent.
V diskusi byla řešena témata:
další potencionální poskytovatelé datových sad, jejich použitelnost