Bakalářská práce se věnuje cílení derivátů komplexů DTC s mědí na kofaktor segregasy p97 NPL4. Literární přehled je zaměřen na ubikvitin-proteazomový systém a segregasu p97, jež je nedílnou a nezbytnou součástí UPS jako regulátor proteostázy. Kofaktory p97 Ufd1/NPL4 obsahují motiv rozpoznávající ubikvitin, čímž umožňují segregase rozpoznávat polyubikvitinované substráty a následně je zpracovat. V posledních letech byl výzkum zaměřen na znovuvyužití již známých léků pro jiné indikace, např léčbu rakoviny, čímž si získal pozornost lék na bázi diethylthiokarbamátu Antabus a jeho inhibiční účinky na p97 a protinádorové vlastnosti. Narušení proteostázy lze využít i pro léčebné účely, kdy narušení vede k akumulaci proteinů, proteotoxicitě a následnému navození apoptózy čímž se zpomalí či úplně zastaví růst tumoru.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis deals with the topic of targeting the cofactor of segregase p97 NPL4 by derivatives of DTC. The literary review is focused on the ubiquitin-proteasome system and segregase p97, which is as regulator of proteostasis an essential component of the UPS. Its cofactors Ufd1/NPL4 contain a ubiquitin-recognizing motif, which allows the segregase to recognize the polyubiquitinated substrates for furthermore processing. In the last years the attention of researches was focused on drug repusposing, where diethythithiocarmate based drug Antabus was put in the light because of its inhibition effects on p97 and anticancer properties. Disruption of proteostasis can be used for medical purposes, as the disruption leads to accumulation of proteins, proteotoxicity and further on to induction of apoptosis, which slows down or completely stops the growth of the tumor. The effector substance CuET unfortunately was not a big success in clinical trials, but its resears is still ongoing, because of its low stability.
Klíčová slova
UPS, p97, proteinová agregace, HSR, DSF, CuET
Klíčová slova v angličtině
UPS, p97, protein aggregation, HSR, DSF, CuET
Rozsah průvodní práce
68 s
Jazyk
CZ
Anotace
Bakalářská práce se věnuje cílení derivátů komplexů DTC s mědí na kofaktor segregasy p97 NPL4. Literární přehled je zaměřen na ubikvitin-proteazomový systém a segregasu p97, jež je nedílnou a nezbytnou součástí UPS jako regulátor proteostázy. Kofaktory p97 Ufd1/NPL4 obsahují motiv rozpoznávající ubikvitin, čímž umožňují segregase rozpoznávat polyubikvitinované substráty a následně je zpracovat. V posledních letech byl výzkum zaměřen na znovuvyužití již známých léků pro jiné indikace, např léčbu rakoviny, čímž si získal pozornost lék na bázi diethylthiokarbamátu Antabus a jeho inhibiční účinky na p97 a protinádorové vlastnosti. Narušení proteostázy lze využít i pro léčebné účely, kdy narušení vede k akumulaci proteinů, proteotoxicitě a následnému navození apoptózy čímž se zpomalí či úplně zastaví růst tumoru.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis deals with the topic of targeting the cofactor of segregase p97 NPL4 by derivatives of DTC. The literary review is focused on the ubiquitin-proteasome system and segregase p97, which is as regulator of proteostasis an essential component of the UPS. Its cofactors Ufd1/NPL4 contain a ubiquitin-recognizing motif, which allows the segregase to recognize the polyubiquitinated substrates for furthermore processing. In the last years the attention of researches was focused on drug repusposing, where diethythithiocarmate based drug Antabus was put in the light because of its inhibition effects on p97 and anticancer properties. Disruption of proteostasis can be used for medical purposes, as the disruption leads to accumulation of proteins, proteotoxicity and further on to induction of apoptosis, which slows down or completely stops the growth of the tumor. The effector substance CuET unfortunately was not a big success in clinical trials, but its resears is still ongoing, because of its low stability.
Klíčová slova
UPS, p97, proteinová agregace, HSR, DSF, CuET
Klíčová slova v angličtině
UPS, p97, protein aggregation, HSR, DSF, CuET
Zásady pro vypracování
literární rešerše, kultivace nádorových linií, určovaní toxicity látek (XTT), fluorescenční mikroskopie
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce studijního programu Biochemie PřF UP, studijního oboru Biotechnologie a genové inženýrství.
Práce bude studentem nejdříve vložena v elektronické podobě ve formátu pdf do systému STAG a doplněna povinnými údaji o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení
Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci )
Odevzdání závěrečné práce na sekretariátě Katedry biotechnologií ve dvou svázaných výtiscích obsahujících CD s elektronickou verzí závěrečné práce proběhne v řádném termínu uvedeném v harmonogramu na webové stránce
Katedry biotechnologií.( http://kbt.upol.cz/ )
Zásady pro vypracování
literární rešerše, kultivace nádorových linií, určovaní toxicity látek (XTT), fluorescenční mikroskopie
Závěrečná práce bude vypracována v souladu s doporučeným stylem pro závěrečné práce studijního programu Biochemie PřF UP, studijního oboru Biotechnologie a genové inženýrství.
Práce bude studentem nejdříve vložena v elektronické podobě ve formátu pdf do systému STAG a doplněna povinnými údaji o své práci (viz Opatření děkana Přírodovědecké fakulty UP v Olomouci k provedení některých ustanovení
Studijního a zkušebního řádu UP v Olomouci a Rigorózního řádu UP v Olomouci )
Odevzdání závěrečné práce na sekretariátě Katedry biotechnologií ve dvou svázaných výtiscích obsahujících CD s elektronickou verzí závěrečné práce proběhne v řádném termínu uvedeném v harmonogramu na webové stránce
Katedry biotechnologií.( http://kbt.upol.cz/ )
Bartkova J, Turi Z, Moudry P, Kraus M, Michalova M, Vaclavkova J, Dzubak P,
Vrobel I, Pouckova P, Sedlacek J, Miklovicova A, Kutt A, Li J, Mattova J,
Driessen C, Dou QP, Olsen J, Hajduch M, Cvek B, Deshaies RJ, Bartek J.
Alcohol-abuse drug disulfiram targets cancer via p97 segregase adaptor NPL4. Nature. 2017 Dec 14;552(7684):194-199
Skrott Z, Cvek B. Diethyldithiocarbamate complex with copper: the mechanism of action in cancer cells. Mini Rev Med Chem. 2012 Oct;12(12):1184-92. Cvek B. Targeting malignancies with disulfiram (Antabuse): multidrug resistance, angiogenesis, and proteasome. Curr Cancer Drug Targets. 2011 Mar;11(3):332-7.
Meyer H, Bug M, Bremer S. Emerging functions of the VCP/p97 AAA-ATPase in the ubiquitin system. Nat Cell Biol. 2012 Feb 2;14(2):117-23.
Finley D. Recognition and processing of ubiquitin-protein conjugates by the proteasome. Annu Rev Biochem. 2009;78:477-513. Hartl FU. Protein Misfolding Diseases. Annu Rev Biochem. 2017 Jun 20;86:21-26.
Bartkova J, Turi Z, Moudry P, Kraus M, Michalova M, Vaclavkova J, Dzubak P,
Vrobel I, Pouckova P, Sedlacek J, Miklovicova A, Kutt A, Li J, Mattova J,
Driessen C, Dou QP, Olsen J, Hajduch M, Cvek B, Deshaies RJ, Bartek J.
Alcohol-abuse drug disulfiram targets cancer via p97 segregase adaptor NPL4. Nature. 2017 Dec 14;552(7684):194-199
Skrott Z, Cvek B. Diethyldithiocarbamate complex with copper: the mechanism of action in cancer cells. Mini Rev Med Chem. 2012 Oct;12(12):1184-92. Cvek B. Targeting malignancies with disulfiram (Antabuse): multidrug resistance, angiogenesis, and proteasome. Curr Cancer Drug Targets. 2011 Mar;11(3):332-7.
Meyer H, Bug M, Bremer S. Emerging functions of the VCP/p97 AAA-ATPase in the ubiquitin system. Nat Cell Biol. 2012 Feb 2;14(2):117-23.
Finley D. Recognition and processing of ubiquitin-protein conjugates by the proteasome. Annu Rev Biochem. 2009;78:477-513. Hartl FU. Protein Misfolding Diseases. Annu Rev Biochem. 2017 Jun 20;86:21-26.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Průběh obhajoby:
V úvodu obhajoby předseda komise prof. Mgr. Miroslav Ovečka, Ph.D. představil studentku přítomným akademickým pracovníkům a hostům. V rámci prezentace své práce studentka seznámila všechny zúčastněné s cíli práce a hlavními metodami využitými při jejím zpracování, dále se získanými výsledky a z nich vyplývajícími závěry.
Následně byl přečten posudek vedoucího práce a oponentní posudek. Odpovědi na otázky a připomínky uvedené v posudku vedoucího bakalářské práce a oponenta studentka zodpověděla.
V rámci veřejné diskuse student zodpověděl následující dotazy položené přítomnými odborníky:
Mgr. Olga Šamajová, Dr.: Byly na konfokální mikroskopii použity vitální nebo fixované preparáty? Byla použita protilátka proti GFP?
prof. Mgr. Miroslav Ovečka, Ph.D.: Je zde korelace s úrovní apoptózy? Je zabezpečená funkčnost proteinu značeného GFP?