Personalizovaná medicína sa zameriava na optimalizáciu liečby podľa vlastností jednotlivých pacientov. Bakalárska práca sa zaoberá kultiváciou nádorových buniek odvodených od kolorektálneho karcinómu v 2D a 3D podmienkách a porovnaniu vplyvu chemoterapeutík na tieto kultivačné modely. V práci sme rovnako vykonali kultiváciu organoidov odvodených od pacientov. Použitím imunohistochemickej analýzy sme porovnávali zachovanie vlastností primárneho tkaniva sledovaním CK20 a CDX2 proteínov v 3D modeloch. Výsledky našich experimentov potvrdili rozdiel medzi 2D a 3D kultivačnými modelmi a možnosť využitia kultivácie pacientských organoidov pre personalizovanú medicínu.
Anotace v angličtině
Personalized medicine focuses on tailoring treatment according to the individual characteristics of patients. The bachelor thesis deals with cultivation of cells derived from colorectal cancer in 2D and 3D conditions and comparing the effect of chemoterapeutics on these culture models. In this work we have also established organoids derived from patient samples. Using immunohistochemical analysis, we have compared the preservation of specific tissue properties by monitoring CK20 and CDX2 proteins in 3D models. The results of our experiments confirmed the difference between 2D and 3D culture models and proved feasibility of patient-derived organoids in personalised medicine.
Klíčová slova
kolorektálny karcinóm, 2D a 3D kultivačné modely, sféroidy a organoidy.
Klíčová slova v angličtině
colorectal cancer, 2D and 3D culture models, spheroids, organoids.
Rozsah průvodní práce
ix s., 46 s.
Jazyk
SK
Anotace
Personalizovaná medicína sa zameriava na optimalizáciu liečby podľa vlastností jednotlivých pacientov. Bakalárska práca sa zaoberá kultiváciou nádorových buniek odvodených od kolorektálneho karcinómu v 2D a 3D podmienkách a porovnaniu vplyvu chemoterapeutík na tieto kultivačné modely. V práci sme rovnako vykonali kultiváciu organoidov odvodených od pacientov. Použitím imunohistochemickej analýzy sme porovnávali zachovanie vlastností primárneho tkaniva sledovaním CK20 a CDX2 proteínov v 3D modeloch. Výsledky našich experimentov potvrdili rozdiel medzi 2D a 3D kultivačnými modelmi a možnosť využitia kultivácie pacientských organoidov pre personalizovanú medicínu.
Anotace v angličtině
Personalized medicine focuses on tailoring treatment according to the individual characteristics of patients. The bachelor thesis deals with cultivation of cells derived from colorectal cancer in 2D and 3D conditions and comparing the effect of chemoterapeutics on these culture models. In this work we have also established organoids derived from patient samples. Using immunohistochemical analysis, we have compared the preservation of specific tissue properties by monitoring CK20 and CDX2 proteins in 3D models. The results of our experiments confirmed the difference between 2D and 3D culture models and proved feasibility of patient-derived organoids in personalised medicine.
Klíčová slova
kolorektálny karcinóm, 2D a 3D kultivačné modely, sféroidy a organoidy.
Klíčová slova v angličtině
colorectal cancer, 2D and 3D culture models, spheroids, organoids.
Zásady pro vypracování
Literárna rešerš študovanej témy
Kultivácia bunkových línií a imunofluorescencia
Disociácia tkanív a kultivácia organoidov
Analýza organoidov a tkanív pomocou imunohistochémie
Optimalizácia opakovaného farbenia rovnakých preparátov, predovšetkým tkanivových
Zásady pro vypracování
Literárna rešerš študovanej témy
Kultivácia bunkových línií a imunofluorescencia
Disociácia tkanív a kultivácia organoidov
Analýza organoidov a tkanív pomocou imunohistochémie
Optimalizácia opakovaného farbenia rovnakých preparátov, predovšetkým tkanivových
Seznam doporučené literatury
Mark N. Stein, Thomas L. Jang: Striving Toward a Cure for Prostate Cancer. Journal of Clinical Oncology, June 20, 2016, DOI: 10.1200/JCO.2015.66.3146;
Jia-Ren Lin, Benjamin Izar, Shu Wang, Clarence Yapp, Shaolin Mei, Parin M Shah, Sandro Santagata, Peter K Sorger: Highly multiplexed immunofluorescence imaging of human tissues and tumors using t-CyCIF and conventional optical microscopes. eLife, July 11, 2018 DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.31657
Jarno Drost, Wouter R. Karthaus, Dong Gao, Else Driehuis, Charles L. Sawyers, Yu Chen, Hans Clevers: Organoid culture systems for prostate epithelial and prostate cancer tissue. Nature Protocol, 2016 February ; 11(2):doi:10.1038/nprot.2016.006
Ayesha A. Shafi et al: Patient-derived Models Reveal Impact of the Tumor Microenvironment on Therapeutic Response. European Urology Oncology, September 2018 https://doi.org/10.1016/j.euo.2018.04.019
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg: Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell 144, March 2011 DOI 10.1016/j.cell.2011.02.013
Seznam doporučené literatury
Mark N. Stein, Thomas L. Jang: Striving Toward a Cure for Prostate Cancer. Journal of Clinical Oncology, June 20, 2016, DOI: 10.1200/JCO.2015.66.3146;
Jia-Ren Lin, Benjamin Izar, Shu Wang, Clarence Yapp, Shaolin Mei, Parin M Shah, Sandro Santagata, Peter K Sorger: Highly multiplexed immunofluorescence imaging of human tissues and tumors using t-CyCIF and conventional optical microscopes. eLife, July 11, 2018 DOI: https://doi.org/10.7554/eLife.31657
Jarno Drost, Wouter R. Karthaus, Dong Gao, Else Driehuis, Charles L. Sawyers, Yu Chen, Hans Clevers: Organoid culture systems for prostate epithelial and prostate cancer tissue. Nature Protocol, 2016 February ; 11(2):doi:10.1038/nprot.2016.006
Ayesha A. Shafi et al: Patient-derived Models Reveal Impact of the Tumor Microenvironment on Therapeutic Response. European Urology Oncology, September 2018 https://doi.org/10.1016/j.euo.2018.04.019
Douglas Hanahan, Robert A. Weinberg: Hallmarks of Cancer: The Next Generation. Cell 144, March 2011 DOI 10.1016/j.cell.2011.02.013
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Obhajobu bakalářské práce studentky Frederiky Lenčéšové zahájil prof. RNDr. Zdeněk Dvořák, DrSc. et Ph.D. Studentka seznámila komisi s hlavními částmi a výsledky své práce. Následovalo přečtení posudku vedoucího práce doc. Mgr. Jana Bouchala, Ph.D. a oponentky Mgr. Aleny Mičkové.
Studentka pak reagovala na připomínky a dotazy.
Prezentace studentky obsahovala tato témata:
- Personalizovaná medicína
- Experimentální provedení práce
- Hodnocení cytotoxicity ve 3D kultivačním systému
V rozpravě byly uvedeny následující připomínky či nastoleny tyto problémy:
- Léčba kolorektálního karcinomu - alternativní přístupy cílící na konkrétní biochemické dráhy
- Účinky potenciálních léčiv a jejich sledování jinými analytickými metodami
- Konkrétní laboratorní práce studentky v rámci bakalářské práce
- Organoid - charakteristika, rozdíl ve srovnání s tradiční buněčnou kulturou
Studentka na dotazy položené oponentkou práce a členy komise reagovala věcně, pohotově a přiměřeně.