Sinice obývají všechny habitaty s dostatkem světla. To zahrnuje také terestrické habitaty. Nicméně diverzita aerofytních sinic není příliš probádaná. Tato práce se zaměřuje na sběr aerofytických sinic se zaměřením na půdní sinice kolem města Konice. Druhová diverzita vzorků bude nejprve determinována pomocí světelné mikroskopie a následně budou izolovány kmeny s použitím standardních metod používaných v Algologické laboratoři. Vyizolované kmeny budou charakterizovány s použitím světelné mikroskopie (morfologická variabilita) a s použitím molekulárních technik jako je sekvenování 16S rRNA.
Anotace v angličtině
Cyanobacteria inhabit all habitats with sufficient light intensity. This involves also terrestrial habitats. However, diversity of aerophytic cyanobacteria is not well studied. This thesis aims at sampling of benthic and aerophytic cyanobateria with a focus to soils near city Konice. A species composition samples will be evaluated using light microscopy and strains will be isolated using standard techniques optimized in Phycological Laboratory. The strains will be characterized using light microscopy (morphological variability) and molecular techniques such as 16S rRNA sequencing.
species diversity, collection of samples, isolation of strains, sequencing, taxonomy, Drahanská vrchovina
Rozsah průvodní práce
31
Jazyk
CZ
Anotace
Sinice obývají všechny habitaty s dostatkem světla. To zahrnuje také terestrické habitaty. Nicméně diverzita aerofytních sinic není příliš probádaná. Tato práce se zaměřuje na sběr aerofytických sinic se zaměřením na půdní sinice kolem města Konice. Druhová diverzita vzorků bude nejprve determinována pomocí světelné mikroskopie a následně budou izolovány kmeny s použitím standardních metod používaných v Algologické laboratoři. Vyizolované kmeny budou charakterizovány s použitím světelné mikroskopie (morfologická variabilita) a s použitím molekulárních technik jako je sekvenování 16S rRNA.
Anotace v angličtině
Cyanobacteria inhabit all habitats with sufficient light intensity. This involves also terrestrial habitats. However, diversity of aerophytic cyanobacteria is not well studied. This thesis aims at sampling of benthic and aerophytic cyanobateria with a focus to soils near city Konice. A species composition samples will be evaluated using light microscopy and strains will be isolated using standard techniques optimized in Phycological Laboratory. The strains will be characterized using light microscopy (morphological variability) and molecular techniques such as 16S rRNA sequencing.
species diversity, collection of samples, isolation of strains, sequencing, taxonomy, Drahanská vrchovina
Zásady pro vypracování
Sinice obývají všechny habitaty s dostatkem světla. To zahrnuje také terestrické habitaty. Nicméně diverzita aerofytních sinic není příliš probádaná. Tato práce se zaměřuje na sběr aerofytických sinic se zaměřením na půdní sinice kolem města Konice. Druhová diverzita vzorků bude nejprve determinována pomocí světelné mikroskopie a následně budou izolovány kmeny s použitím standardních metod používaných v Algologické laboratoři. Vyizolované kmeny budou charakterizovány s použitím světelné mikroskopie (morfologická variabilita) a s použitím molekulárních technik jako je sekvenování 16S rRNA.
Zásady pro vypracování
Sinice obývají všechny habitaty s dostatkem světla. To zahrnuje také terestrické habitaty. Nicméně diverzita aerofytních sinic není příliš probádaná. Tato práce se zaměřuje na sběr aerofytických sinic se zaměřením na půdní sinice kolem města Konice. Druhová diverzita vzorků bude nejprve determinována pomocí světelné mikroskopie a následně budou izolovány kmeny s použitím standardních metod používaných v Algologické laboratoři. Vyizolované kmeny budou charakterizovány s použitím světelné mikroskopie (morfologická variabilita) a s použitím molekulárních technik jako je sekvenování 16S rRNA.
Seznam doporučené literatury
Kaštovský, J., Hauer, T., Geriš, R., Chattová, B., Juráň, J., Lepšová-Skácelová, O., Pitelková, P., Pusztai, M., Škaloud, P., Šťastný, J., Čapková, K., Bohunická, M. & Mühlsteinová, R. (2018): Atlas sinic a řas ČR 1. powerprint, Praha, 384 s.
Dvořák, P., Casamatta, D. A., Hašler, P., Jahodářová, E., Norwich, A. R., Poulíčková, A. (2017): Diversity of the cyanobacteria. In: Modern Topics in the Phototrophic Prokaryotes, Applied and Environmental Aspects (ed.: PatrickC, Hallenbeck), Springer Nature, Switzerland, pp. 3-46.
Seznam doporučené literatury
Kaštovský, J., Hauer, T., Geriš, R., Chattová, B., Juráň, J., Lepšová-Skácelová, O., Pitelková, P., Pusztai, M., Škaloud, P., Šťastný, J., Čapková, K., Bohunická, M. & Mühlsteinová, R. (2018): Atlas sinic a řas ČR 1. powerprint, Praha, 384 s.
Dvořák, P., Casamatta, D. A., Hašler, P., Jahodářová, E., Norwich, A. R., Poulíčková, A. (2017): Diversity of the cyanobacteria. In: Modern Topics in the Phototrophic Prokaryotes, Applied and Environmental Aspects (ed.: PatrickC, Hallenbeck), Springer Nature, Switzerland, pp. 3-46.
Přílohy volně vložené
-
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Zápis průběhu obhajoby bakalářské práce
Páleníčková Kateřina
1. Zahájení - představení studentky, vedoucího a oponenta bakalářské práce
2. Vystoupení studentky - prezentace BP
a. Úvod do problematiky
b. Cíle práce
c. Literární přehled
d. Materiál a metody
e. Výsledky
f. Diskuse
g. Závěr
3. Vystoupení vedoucího práce - posudek
4. Vystoupení oponenta práce - posudek
5. Odpovědi na otázky oponenta
6. Diskuse. Dotaz na návazné téma diplomové práce, ve kterém bude studentka pokračovat? Dotaz na využití didaktické části předložené bakalářské práce.
7. Závěrečné vyhodnocení, uzavření známky
Klasifikace: A
Datum obhajoby: 24. 8. 2020 Doc. RNDr. Vladan Ondřej, Ph.D.
předseda komise