Cílem práce je analýza dat týkajících se výskytu methylovaného cytosinu v dinukleotidech HIV viru. Budeme testovat hypotézu, zda se výskyt těchto vazeb zvyšuje s rostoucí délkou doby od nákazy. Prostředkem bude zobecněný lineární model obsahující jak pevné, tak i náhodné efekty.
Anotace v angličtině
The aim of this thesis is to analyse the data for the presence of the methylated cytosine in the dinucleotides of the HIV virus. We will test the hypothesis whether the presence of these elements increases with the increasing length of the infection. It will be used to generate the linear model containing both the fixed and random effects.
Klíčová slova
AIDS, alternativní rozdělení, HIV, kategoriální proměnné, logistické regrese, metoda maximální věrohodnosti normální rozdělení, pomocné proměnné, reálná aplikace, simulace Monte Carlo, software R, spojovací funkce, zobecněné lineární modely se smíšenými efekty
Klíčová slova v angličtině
AIDS, Alternative Distribution, HIV, Categorical Data, Logistic Regression, Maximum Likelihood Estimation, Normal Distribution, Dummy Variables, Real Application, Simulation Monte Carlo, software R, Link Function, Generalized Linear Mixed Models
Rozsah průvodní práce
52
Jazyk
CZ
Anotace
Cílem práce je analýza dat týkajících se výskytu methylovaného cytosinu v dinukleotidech HIV viru. Budeme testovat hypotézu, zda se výskyt těchto vazeb zvyšuje s rostoucí délkou doby od nákazy. Prostředkem bude zobecněný lineární model obsahující jak pevné, tak i náhodné efekty.
Anotace v angličtině
The aim of this thesis is to analyse the data for the presence of the methylated cytosine in the dinucleotides of the HIV virus. We will test the hypothesis whether the presence of these elements increases with the increasing length of the infection. It will be used to generate the linear model containing both the fixed and random effects.
Klíčová slova
AIDS, alternativní rozdělení, HIV, kategoriální proměnné, logistické regrese, metoda maximální věrohodnosti normální rozdělení, pomocné proměnné, reálná aplikace, simulace Monte Carlo, software R, spojovací funkce, zobecněné lineární modely se smíšenými efekty
Klíčová slova v angličtině
AIDS, Alternative Distribution, HIV, Categorical Data, Logistic Regression, Maximum Likelihood Estimation, Normal Distribution, Dummy Variables, Real Application, Simulation Monte Carlo, software R, Link Function, Generalized Linear Mixed Models
Zásady pro vypracování
Cílem práce je analýza dat týkajících se výskytu metylovaného cytosinu v dinukleotidech HIV viru. Budeme testovat hypotézu, zda se výskytu těchto vazeb zvyšuje s rostoucí délkou doby od nákazy. Prostředkem bude zobecněný lineární model obsahující jak pevné, tak i náhodné efekty.
Zásady pro vypracování
Cílem práce je analýza dat týkajících se výskytu metylovaného cytosinu v dinukleotidech HIV viru. Budeme testovat hypotézu, zda se výskytu těchto vazeb zvyšuje s rostoucí délkou doby od nákazy. Prostředkem bude zobecněný lineární model obsahující jak pevné, tak i náhodné efekty.
Seznam doporučené literatury
Agresti, A.: Categorical data analysis
Hedeker, D.: Generalized Linear Mixed Models
Seznam doporučené literatury
Agresti, A.: Categorical data analysis
Hedeker, D.: Generalized Linear Mixed Models
Přílohy volně vložené
CD
Přílohy vázané v práci
-
Převzato z knihovny
Ano
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
V úvodu obhajoby studentka komisi seznámila s obsahem své diplomové práce s názvem Zobecněné lineární modely se smíšenými efekty s aplikací ve výzkumu HIV pomocí prezentace. V diskusi uspokojivě zodpověděla dotazy oponentky na funkci GLMM a interpretaci odhadnutých koeficientů ve vytvořených modelech a též uspokojivě reagovala na dotaz vedoucího komise. Komise se proto shodla na výsledném hodnocení klasifikačním stupněm D.