|
Vyučující
|
-
Jedelská Tereza, Mgr. Ph.D.
-
Kováč Ondřej, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Úvodní seminář ? enzymy v kontextu biochemie. Enzymová evoluce a inženýrství enzymů - přirozená evoluce enzymů, adaptace a diverzita, protein engineering, jak vznikají nové biokatalyzátory. 2. Kinetika enzymových reakcí I ? základní principy: význam parametrů Km a Vlim, praktické příklady (grafická znázornění, interpretace experimentálních dat). Lineární transformace a jejich limity. Praktické cvičení: výpočet parametrů z experimentálních dat. 3. Kinetika enzymových reakcí II ? pokročilejší pohled: allosterická regulace, kooperativita, inhibice enzymů, farmakologický význam enzymových inhibitorů. Praktické cvičení k inhibici: tvorba a interpretace grafů. 4. Enzymová evoluce a bioinformatika enzymů ? diverzita enzymových rodin, homologie, motivy a domény, in silico predikce funkce enzymu. Praktické cvičení: analýza sekvence pomocí dostupných databází. 5. Metody studia enzymů ? strukturální a moderní přístupy (krystalografie, NMR, cryo-EM, molekulární dynamika, biosenzory, high-throughput screening). 6. Enzymy: biologické metody v asymetrické syntéze (chirální resoluce pomocí enzymů, použití lipas, esteras, enzymatické oxidace, nukleofilní adice, praktická asymetrická syntéza s enzymy).
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Projekce (statická, dynamická), Aktivizující práce ve skupinách
|
|
Výstupy z učení
|
Rozšíření předmětu Enzymologie (KBC/ENZ). Cílem předmětu je prohloubit znalosti studentů o principech struktury, funkce, kinetiky a regulace enzymů a seznámit je s moderními metodami jejich studia. Současně má studenty vést k pochopení významu enzymů v biotechnologii, medicíně a průmyslových aplikacích a rozvíjet jejich schopnost pracovat s experimentálními daty.
Student rozumí principům enzymové katalýzy, kinetice a regulaci enzymů, zná základní metodické přístupy jejich studia a chápe význam enzymů v biologii, medicíně a biotechnologiích.
|
|
Předpoklady
|
Základní znalosti z biochemie.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Analýza výkonů studenta
100 % účastí na semináři a splnění praktických cvičení.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Bisswanger, H. (2019). Practical Enzymology. Wiley-VCH Verlag GmbH.
-
Editors: Munishwar Nath Gupta, Vladimir N. Uversky. (2022). Structure and Intrinsic Disorder in Enzymology (2022). Elsevier.
-
Nigel S. Scrutton. (2023). Unravelling the complexity of enzyme catalysis. FEBS Journal.
-
Purich D. L. (2010). Enzyme Kinetics: Catalysis and Control. London.
|