|
Vyučující
|
-
Danihlík Jiří, Mgr. Ph.D.
-
Sekaninová Jana, Mgr. Ph.D.
-
Zalabák David, Mgr. Ph.D.
-
Janků Martina, Mgr. Ph.D.
-
Dostálková Silvie, Mgr. Ph.D.
-
Vrobel Ondřej, Mgr. Ph.D.
-
Hrtánková Eva, Mgr.
-
Jemelková Jana, Mgr. Ph.D.
-
Jedelská Tereza, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Diskontinuální elektroforéza v polyakrylamidovém gelu za přítomnosti dodecylsulfátu sodného (SDS-PAGE) s následným western blottingem na PVDF membránu. Imunochemická detekce proteinů na PVDF membráně. Stanovení cukrů metodou HPLC. Stanovení biogenních aminů pomocí kapalinové chromatografie spojené s hmotnostní spektrometrií. Světelná mikroskopie. Isoelektrická fokusace. Aplikace bioinformatických metod při analýze proteinů. PCR - identifikace transformovaných bakteriálních kolonií. Enzymová kinetika.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Laborování, Aktivizující práce ve skupinách
- Účast na výuce
- 52 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 20 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem předmětu je naučit studentyrealizovat v praxi základní separační a instrumentální metody používané v biochemických laboratořích.
Pochopení principu metod a získání praktických zkušeností při realizaci základních i pokročilých biochemických metod.
|
|
Předpoklady
|
Potřebné jsou znalosti a dovednosti získané absolvováním předmětů zaměřených na biochemii, biochemické metody a rovněž absolvováním laboratorních cvižení z biochemie a laboratorní techniky.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Analýza výkonů studenta, Systematické pozorování studenta, Písemný test
1) 100% účast na cvičení (možnost nahrazení do 2 absencí ze závažných důvodů, výjimečné situace se budou řešit individuálně, např. pobyt v nemocnici). Případnou absenci je nutné vždy omluvit písemně (email) předem ještě před začátkem cvičení. 2) Odevzdané a uznané protokoly ze všech cvičení. Dvojice studentů řešící spolu danou úlohu odevzdá jeden společný protokol v elektronické formě. Vypracované protokoly je nutné odevzdat nejpozději do začátku následujícího cvičení do 7 dnů od absolvování cvičení. Za každý řádně v termínu odevzdaný protokol, který je správně vypracovaný, student získá 20 bodů. V případě nedodržení termínu odevzdání protokolu je studentům 10 bodů odečteno. Protokol je po odevzdání opraven a obodován. Protokoly už poté nepodléhají dalším opravám. 3) V průběhu cvičení bude prověřena připravenost studenta formou testu (5 otázek z teoretické i praktické části dané úlohy). Každá správně zodpovězená otázka je ohodnocena 2 body. Při získání 3 a méně bodů z testu je student ze cvičení vykázán a cvičení si musí zopakovat v náhradním termínu. Při získání 4-5 bodů je vedoucí povinen studenta přezkoušet ústně, v případě neznalosti daného tématu je student ze cvičení vykázán a cvičení si musí zopakovat v náhradním termínu. Z důvodu nepřipravenosti je možné nahradit cvičení pouze 1x. 4) Student musí splnit všechny požadavky pro splnění předmětu a získat potřebný počet bodů za připravenost a odevzdané protokoly, a to do dvou týdnu od posledního cvičení. Po dvou týdnech od ukončení cvičení je vyhodnocen bodový zisk a splnění požadavků kladených na získání zápočtu tohoto předmětu, tj 100% účast na cvičení a odevzdané a uznané všechny protokoly. Kritéria bodového hodnocení: 75 - 100 % bodů - Zápočet je udělen (1. řádný pokus). 50 - 75 % bodů - Student bude psát zápočtový test (test musí být napsán na více než 70 % bodů pro udělení zápočtu, zápočtový test je možné opakovat pouze jednou (2. a 3. řádný pokus). < 50 % bodů - Studentovi zápočet nebude udělen, předmět si musí zapsat znovu v příštím roce.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Katoch, R. (2011). Analytical techniques in biochemistry and molecular biology. Springer, New York.
-
Králová, B. (2001). Bioanalytické metody. VŠChT.
-
Nováková, L., Douša, M. a kol. (2013). Moderní HPLC separce v teorii a praxi I. Europrint, 2013.
-
Nováková, L., Douša, M. a kol. (2013). Moderní HPLC separce v teorii a praxi II. Europrint, 2013.
-
Pingoud, A., Urbanke, C., Hoggett J., Jeltsch, A. (2002). Biochemical Methods, A Concise Guide for Students and Researchers. Wiley-VCH, Weinheim.
-
Šebela, M. a kol. (2016). Experimentální metody biochemie (elektronická skripta). Olomouc.
-
Vashist S., Luong J. (2018). Handbook of Immunoassay Technologies 1st Edition. Academic Press.
|