|
Vyučující
|
-
Friedecký David, prof. RNDr. Ph.D.
-
Kvasnička Aleš, Mgr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Předmět vyžaduje pochopení základních statistických metod, které byly prezentovány v předmětu "Základní statistické zpracování dat". Přesuneme se od jednorozměrných k vícerozměrným statistickým metodám a zaměříme se na to, jak je vizualizovat. Budou diskutovány typické problémy mnohorozměrné statistiky (chybějící hodnoty, nuly; transformace dat; vztah mezi proměnnými - korelace). Budou studovány metody hlavních komponent (PCA) a její intepretace (konstrukce, interpretace, grafické výstupy - biplot), shluková analýza (dendrogram, self organizing maps), klasifikační přístupy (PLS-DA, OPLS-DA) a jejich využití v diagnostice/predikci onemocnění. Pro tyto účely budeme pracovat v software Statistica a SIMCA. Předmět bude dále zaměřen na statistické metody a postupy používané v laboratorní diagnostice jako např. analýza přežití, Bland-Altman pro porovnání dvou metod, korelační matice, nástroje pro kontrolu kvality a další.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace, Aktivizující práce ve skupinách
- Účast na výuce
- 26 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 10 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem je rozšířit znalosti studentů v oblasti statistiky se zaměřením na vícerozměrné statistické metody a jejich vizualizace
Student získá znalosti týkající se statistických metod a postupů používaných v laboratorní diagnostice
|
|
Předpoklady
|
Znalosti základní statistiky získané absolvováním předmětu KBC/ZSZD (Základní statistické zpracování dat)
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Analýza výkonů studenta, Systematické pozorování studenta
|
|
Doporučená literatura
|
-
Dharmaraja Selvamuthu, Dipayan Das. (2018). Introduction to Statistical Methods, Design of Experiments and Statistical Quality Control.
-
Editor: Bernd Mayer. (2011). Bioinformatics for Omics Data: Methods and Protocols.
-
Hans-Michael Kaltenbach. (2021). Statistical Design and Analysis of Biological Experiments.
-
Shuzhao Li. (2020). Computational Methods and Data Analysis for Metabolomics.
|