Předmět: Omické metody v diagnostice

« Zpět
Název předmětu Omické metody v diagnostice
Kód předmětu KBC/OM
Organizační forma výuky Přednáška
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia nespecifikován
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 2
Vyučovací jazyk Čeština
Statut předmětu Povinně-volitelný, Volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Rozhon Jakub, Mgr.
  • Brumarová Radana, Mgr. Ph.D.
  • Friedecký David, prof. RNDr. Ph.D.
Obsah předmětu
Metabolomika, lipidomika a proteomika představují zástupce tzv. omics metod, kde se uplatňuje kombinace separačních technik s hmotností spektrometrii pro studium komplexního profilu metabolitů (metabolom) a lipidů (lipidom) a proteinů (proteom). Tyto metody našly široké uplatnění jednak v pochopení patobiochemických procesů a při hledání nových biomarkerů u studovaných onemocnění. V předmětu Omické metody v diagnostice budou studenti detailně seznámeni: 1. s problematikou realizace celého proteomického, metabolomického a lipidomického workflow 2. se základními používanými metodickými postupy pro přípravu vzorků, analýzu a následné zpracování dat a statistické vyhodnocení.

Studijní aktivity a metody výuky
Přednášení
  • Účast na výuce - 13 hodin za semestr
  • Příprava na zkoušku - 20 hodin za semestr
Výstupy z učení
Cílem předmětu je seznámit s tudenty s intenzivně se rozvíjejícími vědními obory jako je metabolomika, lipidomika a proteomika představující zástupce tzv. omics metod.
Student získá informace týkající se principů, metodických přístupů a realizaci omických metod.
Předpoklady
Základní znalosti z biochemie a biochemických a analytických metod.

Hodnoticí metody a kritéria
Ústní zkouška

Doporučená literatura
  • Editors: Alessandra Sussulini. Metabolomics: From Fundamentals to Clinical Applications, 2017.
  • Editors: ByRon Wehrens, Reza Salek. Metabolomics, Practical Guide to Design and Analysis, 2019.
  • Editors: Martin Giera. Clinical Metabolomics, Methods and Protocols, 2018.
  • Editors: Paul Wood. Lipidomics, 2017.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Analytický biochemik (2024) Kategorie: Chemické obory 1 Doporučený ročník:1, Doporučený semestr: Zimní
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biochemie (2022) Kategorie: Chemické obory - Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Zimní