Předmět: Experimentální metody studia obranné reakce rostlin

« Zpět
Název předmětu Experimentální metody studia obranné reakce rostlin
Kód předmětu KBC/EMOR
Organizační forma výuky Cvičení
Úroveň předmětu Magisterský
Rok studia 2
Semestr Zimní
Počet ECTS kreditů 7
Vyučovací jazyk Čeština, Angličtina
Statut předmětu Povinně-volitelný
Způsob výuky Kontaktní
Studijní praxe Nejedná se o pracovní stáž
Doporučené volitelné součásti programu Není
Vyučující
  • Jedelská Tereza, Mgr. Ph.D.
  • Dostálková Silvie, Mgr. Ph.D.
  • Janků Martina, Mgr. Ph.D.
  • Jahnová Jana, Mgr.
  • Sekaninová Jana, Mgr. Ph.D.
Obsah předmětu
Cvičení probíhá formou blokové výuky na konci zimního semestru. Garant předmětu informuje studenty o průběhu cvičení na začátku semestru. Termíny cvičení jsou zasílány studentům minimálně 3 týdny před zahájením blokové výuky. Jednotlivé úlohy cvičení jsou zaměřeny na zpracování kontrolních a stresovaných rostlinných vzorků a následné analýzy spektrofotometrickými, fluorimetrickými, elektroforetickými, histochemickými a molekulárně-biologickými metodami: 1. Zpracování zamraženého rostlinného materiálu (kontrolní rostliny a rostliny stresované působením abiotických stresových faktorů). Homogenizace, extrakce. 2. Práce s rostlinnými buňkami. Stanovení životnosti a buněčné smrti při působení stresových faktorů (mikroskopie, spektrofotometrie). 3. Lokalizace produkce reaktivních forem kyslíku a dusíku v rostlinných pletivech (fluorescenční mikroskopie). 4. Spektrofotometrické stanovení aktivity antioxidačních enzymů a antioxidační kapacity (multifunkční reader). 5. Stanovení produkce heat shock proteinů v kontrolních a stresovaných rostlinách (SDS-PAGE, Western blotting, imunodetekce). 6. Analýza rozdílů mezi kontrolními a stresovanými rostlinami pomocí molekulárně biologických metod (PCR, qPCR).

Studijní aktivity a metody výuky
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Pozorování, Demonstrace, Nácvik pohybových a pracovních dovedností, Laborování
  • Domácí příprava na výuku - 100 hodin za semestr
  • Účast na výuce - 104 hodin za semestr
Výstupy z učení
Studenti budou seznámeni a prakticky procvičeni s běžnými experimentálními metodami používanými při studiu reakcí rostlin na stresové podmínky.
Procvičovat a aplikovat pokročilé postupy a metody stresové biochemie a fyziologie rostlin a tvořivě je používat v praxi.
Předpoklady
Potřebné jsou znalosti a dovednosti získané úspěšným absolvováním předmětu KBC/BCH Základy biochemie.

Hodnoticí metody a kritéria
Analýza výkonů studenta, Systematické pozorování studenta

1) 100% účast na cvičení (možnost nahrazení do 2 absencí ze závažných důvodů, výjimečné situace se budou řešit individuálně, např. pobyt v nemocnici). Případnou absenci je nutné vždy omluvit písemně (email) předem ještě před začátkem cvičení. 2) Odevzdaný a uznaný protokol ze všech cvičení. Dvojice studentů řešící spolu dané úlohy odevzdá jeden společný protokol v elektronické formě. Vypracovaný protokol je nutné odevzdat nejpozději 10 dnů od absolvování posledního cvičení! Za protokol odevzdaný v řádném termínu, který je správně vypracovaný, studenti získají 30 bodů. V případě nedodržení termínu odevzdání protokolu je studentům 15 bodů odečteno. Protokol je po odevzdání opraven a obodován. Protokol už poté nepodléhá dalším opravám. 3) V průběhu cvičení bude prověřena připravenost studenta formou písemného zkoušení (5 otázek z teoretické i praktické části dané úlohy). Každá správně zodpovězená otázka je ohodnocena 2 body. Maximální počet bodů je 10 bodů. Při získání 3 a méně bodů z testu je student ze cvičení vykázán a cvičení si musí zopakovat v náhradním termínu. Při získání 4-5 bodů je vedoucí povinen studenta přezkoušet ústně, v případě neznalosti daného tématu je student ze cvičení vykázán a cvičení si musí zopakovat v náhradním termínu. Z důvodu nepřipravenosti je možné nahradit cvičení pouze 1x. 4) Student musí splnit všechny požadavky pro splnění předmětu a získat potřebný počet bodů za připravenost a odevzdaný protokol. Po uznání protokolu je vyhodnocen bodový zisk a splnění požadavků kladených na získání zápočtu tohoto předmětu, tj 100% účast na cvičení a odevzdaný a uznaný protokol. Kritéria bodového hodnocení: 75 - 100 % bodů - Zápočet je udělen (1. řádný pokus). 50 - 75 % bodů - Student bude psát zápočtový test (test musí být napsán na více než 70 % bodů pro udělení zápočtu, zápočtový test je možné opakovat pouze jednou (2. a 3. řádný pokus). < 50 % bodů - Studentovi zápočet nebude udělen, předmět si musí zapsat znovu v příštím roce.
Doporučená literatura
  • Kesawat MS et al. Regulation of Reactive Oxygen Species during Salt Stress in Plants and Their Crosstalk with Other Signaling Molecules?Current Perspectives and Future Directions. 2023.
  • Mondal S et al. Crucial plant processes under heat stress and tolerance through heat shock proteins. 2023.


Studijní plány, ve kterých se předmět nachází
Fakulta Studijní plán (Verze) Kategorie studijního oboru/specializace Doporučený ročník Doporučený semestr
Fakulta: Přírodovědecká fakulta Studijní plán (Verze): Biochemie (2022) Kategorie: Chemické obory 2 Doporučený ročník:2, Doporučený semestr: Zimní