|
Vyučující
|
-
Duchoslav Martin, RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
1. Úvod, typy ekologických výzkumů, terminologie, historické poznámky 2. Sběr dat - objektivita, design studia, interpretace výsledků, úskalí sběru dat 3. Vlastnosti dat o vegetaci - tabulace a manipulace s daty, hodnocení vazeb a podobností mezi druhy a snímky, diverzita, druhová bohatost, dominance 4. Kalibrace - ekologická analýza - indikační hodnoty (Ellenberg) 5. Vlastnosti biosystematických dat - jejich sběr, typy proměnných, problém multikolinearity 6. Metody mnohorozměrné analýzy. a) nepřímá a přímá gradientová analýza (ordinace), typy analýz, programy CANOCO verze 5, prostředí R: VEGAN, PERMANOVA. b) klasifikační metody (nehiearchická klasifikace, shluková analýza, divizivní klasifikace, diskriminační analýza, regresní a klasifikační stromy, speciální techniky), PC-ORD, VEGAN, TWINSPAN, STATISTICA, NCSS 9, klasifikační a analytický program JUICE. 7. Využití mocného nástroje analýzy dat - programovacího jazyku R - v ekologii: seznámení se základními funkcemi a potenciálem tohoto freeware. 8. Prostorový a časový aspekt dat (autokorelace, prostorová struktura, korelace prostředí - geografie, Mantelův test, point spatial analysis), numerické metody v praxi: příklady studií atd.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Projekce (statická, dynamická), Laborování
|
|
Výstupy z učení
|
Předmět je zaměřen na metodologii designu, sběru, analýzy a interpretace dat z pozorování a experimentů v ekologii společenstev rostlin a živočichů a v biosystematice.
Po absolvování kurzu by student měl být schopen: - Vysvětlit základní pojmy rostlinné ekologie. - Sbírat správně ekologická data, navrhnout design experimentů. - Analyzovat získaná data vhodnými statistickými postupy (JUICE, CANOCO for Windows, TWINSPAN, STATISTICA, R) a správně interpretovat získané výsledky. - Navrhnout, realizovat a vyhodnotit biosystematická data, za využití mnohorozměrných technik.
|
|
Předpoklady
|
Doporučuje se absolvovat libovolný kurz z Ekologie a kurz Biostatistiky.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Známkou, Písemná zkouška
Kombinovaná zkouška v rozsahu probírané látky: písemný test a řešení příkladů na PC
|
|
Doporučená literatura
|
-
Jongman, R.H., Braak ter, C.J.F., Tongeren van, O.F.R. (1995). Data analysis in community and landscape ecology.. Cambridge University Press.
-
Kent, M., Coker, P. (1992). Vegetation Description and Analysis.. Belhaven Press, London.
-
Legendre P., Legendre L. (2012). Numerical Ecology. 3rd edition. Elsevier, Amsterdam.
-
Lepš, J., & Šmilauer, P. (2003). Multivariate analysis of ecological data using CANOCO. Cambridge: Cambridge University Press.
-
Magurran, A. E., McGill, B. J. (2011). Biological diversity: Frontiers in measurement and assessment. Oxford Univ. Press.
-
Schneiner SM., Gurevitch J. (2001). Design and analysis of ecological experiments. Oxford University Press.
-
ter Braak C.J.F, Šmilauer P. (2012). Canoco reference manual and users guide. České Budějovice.
-
Wildi, O. (2013). Data analysis in vegetation ecology. Hoboken, N.J: Wiley-Blackwell.
|