|
Vyučující
|
-
Sedlářová Michaela, doc. RNDr. Ph.D.
|
|
Obsah předmětu
|
Náplní předmětu jsou principy, historie a nejmodernější aplikace světelné (včetně fluorescenční a konfokální) mikroskopie a dalších zobrazovacích technik (mikroskopie elektronová, atomárních sil, elektronové tomografie); základní principy přípravy mikroskopických preparátů pro různé mikroskopické metody a korelativní mikroskopie; fotodokumentace a úpravy mikrofotografií pro publikační účely; matematické metody při zpracování digitálních dat, analýza obrazu (úpravy histogramů, měření rozměrů, počítání objektů, 3D modely). 1. Úvod, historie zobrazování, přehled a srovnání přímých a nepřímých mikroskopických metod 2. Světelná mikroskopie a její modifikace (fázový kontrast, polarizované světlo, temné pole, Nomarského DIC), objektivy 3. Fluorescenční mikroskopie - princip fluorescence, fluorochromy, transmisní a epifluorescenční mikroskopy, dekonvoluce 4. Příprava biologických vzorků pro fluorescenční mikroskopii - histochemické a imunohistochemické značení, fúzní proteiny 5. Konfokální mikroskopie - KM s rotujícím diskem, laserový skenovací (syn. rastrovací nebo řádkovací) KM, multifotonová KM 6. Elektronová mikroskopie - historie, princip, vakuum 7. SEM - skenovací elektronová mikroskopie 8. TEM - transmisní elektronová mikroskopie 9. Skenovací tunelová mikroskopie, mikroskopie atomárních sil 10. Další zobrazovací metody a jejich kombinace (korelační mikroskopie, optická skenovací mikroskopie v blízkém poli, magnetická rezonance) 11. Seznámení s aktuálními trendy v mikroskopii zvaní odborníci z praxe 12. Seznámení s aktuálními trendy v mikroskopii krátká prezentace studentů na vybrané téma
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
|
Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická)
|
|
Výstupy z učení
|
Studenti budou seznámeni s mikroskopickými technikami a softwary pro zpracování obrazových dat.
Po absolvování předmětu by měl student: - ovládat mikroskopické techniky - zpracovávat obrazová data
|
|
Předpoklady
|
Současné absolvování předmětu BOT/MOAC
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Ústní zkouška, Písemná zkouška
Účast + seminární práce
|
|
Doporučená literatura
|
-
Claxton N.S., Fellers TJ., Davidson M.W. (2004). Laser Scanning Confocal Microscopy.
-
Karlík M. (2011). Úvod do transmisní elektronové mikroskopie. ČVUT, Praha.
-
Price R., Jerome J. (2010). Basic Confocal Microscopy.
|