|
Vyučující
|
|
|
|
Obsah předmětu
|
NMR spektroskopie představuje jednu z nejvýznamnějších spektrálních metod pro řešení struktury molekul. Za padesát let svého vývoje se stala vyspělou metodikou nejen pro studium struktury v kapalné i pevné fázi, ale i pro výzkum chování molekul v kapalné fázi. Zejména možnost postihnout chování dynamického systému v kapalné fázi dělá z NMR spektroskopie jednu z předních metod pro studium molekulárního rozpoznávání v biologických systémech za fyziologických podmínek. Je tak možné studovat vazbu léčiv na receptory, interakci proteinů a DNA nebo RNA, atd. Tento předmět si klade za cíl rozšířit a prohloubit znalosti studentů týkající se metodických postupů při určování struktury organických molekul a biomakromolekul. To by mělo dovolit pochopit postupy, které se využívají při studiu vlastností a chování organických molekul a biomakromolekul pomocí NMR. 1. Jev nukleární magnetické rezonance, základní pojmy. 2. Vznik NMR signálu, praktické provedení NMR experimentu, Fourierova transformace, základní pulsní sekvence (spinové echo). 3. Jaderná relaxace, NOE a jeho význam, chemická výměna. 4. NMR parametry - chemický posun, interakční konstanta J a multiplicita signálu, dipolární interakce D, NOE. 5. Charakterizace struktury organických látek: - 1H NMR spektra, homonukleární korelace - J-resolved, COSY, TOCSY - 13C NMR, heteronukleární korelace - HMQC, HSQC, HMBC - selektivní a band-selektivní experimenty. 6. Interpretace spekter. Řešení konformace pomocí NMR - aplikace NMR parametrů závislých na konformaci. 7. Biomakromolekuly- nukleové kyseliny a proteiny, značení stabilními izotopy - 13C, 15N a 2H 8. NMR biomakromolekul - základní strategie. 9. Studium nevazebných interakcí biomakromolekul s ligandy.
|
|
Studijní aktivity a metody výuky
|
Přednášení, Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming)
- Účast na výuce
- 26 hodin za semestr
- Domácí příprava na výuku
- 26 hodin za semestr
- Příprava na zápočet
- 38 hodin za semestr
|
|
Výstupy z učení
|
Cílem je seznámit se s možnostmi a využitím NMR spektroskopie pro org. látky.
Vysvětlit principy, popsat řešení, řešit problémy a interpretovat data získaná pomocí NMR
|
|
Předpoklady
|
Znalost základů analytické chemie a instrumentálních metod.
|
|
Hodnoticí metody a kritéria
|
Analýza výkonů studenta
Zvládnutí teoretických základů, schopnost orientace ve zpracování dat NMR, zpracování semestrální práce.
|
|
Doporučená literatura
|
-
Buděšínský M., Pelnař J. (2000). Cyklus Organická chemie, svazek 25 - Fyzikálně-chemické metody (Nukleární magnetická rezonance). Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, Praha.
-
Derome A. E. (1997). Modern NMR techniques for chemistry research. Pergamon Press.
-
Freeman R. (2003). Magnetic resonance in chemistry and medicine. Oxford University Press, New York.
|