| Název předmětu | Mikroskopie a obrazová analýza pro biochemiky |
|---|---|
| Kód předmětu | BOT/MOAX |
| Organizační forma výuky | Přednáška + Cvičení |
| Úroveň předmětu | Magisterský |
| Rok studia | nespecifikován |
| Semestr | Zimní |
| Počet ECTS kreditů | 4 |
| Vyučovací jazyk | Čeština |
| Statut předmětu | Volitelný |
| Způsob výuky | Kontaktní |
| Studijní praxe | Nejedná se o pracovní stáž |
| Doporučené volitelné součásti programu | Není |
| Vyučující |
|---|
|
| Obsah předmětu |
|
Náplní předmětu jsou principy, historie a nejmodernější aplikace světelné (včetně fluorescenční a konfokální) mikroskopie a dalších zobrazovacích technik (mikroskopie elektronová, atomárních sil, elektronové tomografie); základní principy přípravy mikroskopických preparátů pro různé mikroskopické metody a korelativní mikroskopie; fotodokumentace a úpravy mikrofotografií pro publikační účely; matematické metody při zpracování digitálních dat, analýza obrazu (úpravy histogramů, měření rozměrů, počítání objektů, 3D modely). 1. Úvod, historie zobrazování, přehled a srovnání přímých a nepřímých mikroskopických metod 2. Světelná mikroskopie a její modifikace (fázový kontrast, polarizované světlo, temné pole, Nomarského DIC), objektivy 3. Fluorescenční mikroskopie - princip fluorescence, fluorochromy, transmisní a epifluorescenční mikroskopy, dekonvoluce 4. Příprava biologických vzorků pro fluorescenční mikroskopii - histochemické a imunohistochemické značení, fúzní proteiny 5. Konfokální mikroskopie - KM s rotujícím diskem, laserový skenovací (syn. rastrovací nebo řádkovací) KM, multifotonová KM 6. Elektronová mikroskopie - historie, princip, vakuum 7. SEM - skenovací elektronová mikroskopie 8. TEM - transmisní elektronová mikroskopie 9. Skenovací tunelová mikroskopie, mikroskopie atomárních sil 10. Další zobrazovací metody a jejich kombinace (korelační mikroskopie, optická skenovací mikroskopie v blízkém poli, magnetická rezonance) 11. Seznámení s aktuálními trendy v mikroskopii zvaní odborníci z praxe 12. Seznámení s aktuálními trendy v mikroskopii krátká prezentace studentů na vybrané téma
|
| Studijní aktivity a metody výuky |
| Dialogická (diskuze, rozhovor, brainstorming), Demonstrace, Projekce (statická, dynamická) |
| Výstupy z učení |
|
Studenti budou seznámeni s mikroskopickými technikami a softwary pro zpracování obrazových dat.
Po absolvování předmětu by měl student: - ovládat mikroskopické techniky - zpracovávat obrazová data |
| Předpoklady |
|
Současné absolvování předmětu BOT/MOAC
|
| Hodnoticí metody a kritéria |
|
Ústní zkouška, Písemná zkouška
Účast + seminární práce |
| Doporučená literatura |
|
| Studijní plány, ve kterých se předmět nachází |
| Fakulta | Studijní plán (Verze) | Kategorie studijního oboru/specializace | Doporučený semestr | |
|---|---|---|---|---|
| Fakulta: Přírodovědecká fakulta | Studijní plán (Verze): Botanika (2021) | Kategorie: Biologické obory | - | Doporučený ročník:-, Doporučený semestr: Zimní |